Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC7

TMCO6, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO6Q96DC7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCO6Q96DC7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCO6Q96DC7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMCO6Q96DC7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMCO6Q96DC7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMCO6Q96DC7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMCO6Q96DC7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMCO6Q96DC7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TMCO6Q96DC7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TMCO6Q96DC7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMCO6Q96DC7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMCO6Q96DC7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TMCO6Q96DC7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMCO6Q96DC7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMCO6Q96DC7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMCO6Q96DC7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMCO6Q96DC7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMCO6Q96DC7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMCO6Q96DC7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMCO6Q96DC7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMCO6Q96DC7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMCO6Q96DC7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMCO6Q96DC7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMCO6Q96DC7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TMCO6Q96DC7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMCO6Q96DC7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMCO6Q96DC7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMCO6Q96DC7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMCO6Q96DC7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMCO6Q96DC7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMCO6Q96DC7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMCO6Q96DC7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TMCO6Q96DC7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMCO6Q96DC7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMCO6Q96DC7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMCO6Q96DC7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMCO6Q96DC7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMCO6Q96DC7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMCO6Q96DC7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMCO6Q96DC7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TMCO6Q96DC7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMCO6Q96DC7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMCO6Q96DC7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMCO6Q96DC7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMCO6Q96DC7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMCO6Q96DC7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMCO6Q96DC7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMCO6Q96DC7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMCO6Q96DC7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMCO6Q96DC7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMCO6Q96DC7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMCO6Q96DC7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMCO6Q96DC7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMCO6Q96DC7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMCO6Q96DC7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMCO6Q96DC7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMCO6Q96DC7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMCO6Q96DC7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMCO6Q96DC7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMCO6Q96DC7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMCO6Q96DC7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMCO6Q96DC7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMCO6Q96DC7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMCO6Q96DC7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TMCO6Q96DC7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMCO6Q96DC7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMCO6Q96DC7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMCO6Q96DC7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMCO6Q96DC7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMCO6Q96DC7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TMCO6Q96DC7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TMCO6Q96DC7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMCO6Q96DC7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMCO6Q96DC7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMCO6Q96DC7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMCO6Q96DC7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMCO6Q96DC7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCO6Q96DC7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCO6Q96DC7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCO6Q96DC7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCO6Q96DC7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCO6Q96DC7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCO6Q96DC7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCO6Q96DC7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMCO6Q96DC7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMCO6Q96DC7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TMCO6Q96DC7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMCO6Q96DC7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMCO6Q96DC7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMCO6Q96DC7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMCO6Q96DC7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMCO6Q96DC7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMCO6Q96DC7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMCO6Q96DC7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMCO6Q96DC7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMCO6Q96DC7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMCO6Q96DC7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMCO6Q96DC7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMCO6Q96DC7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMCO6Q96DC7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 308.8 ms