Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNDC9Q8TBE3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNDC9Q8TBE3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNDC9Q8TBE3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNDC9Q8TBE3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNDC9Q8TBE3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNDC9Q8TBE3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNDC9Q8TBE3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNDC9Q8TBE3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FNDC9Q8TBE3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNDC9Q8TBE3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNDC9Q8TBE3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FNDC9Q8TBE3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FNDC9Q8TBE3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FNDC9Q8TBE3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FNDC9Q8TBE3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FNDC9Q8TBE3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FNDC9Q8TBE3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FNDC9Q8TBE3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FNDC9Q8TBE3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FNDC9Q8TBE3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FNDC9Q8TBE3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FNDC9Q8TBE3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNDC9Q8TBE3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNDC9Q8TBE3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNDC9Q8TBE3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FNDC9Q8TBE3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNDC9Q8TBE3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FNDC9Q8TBE3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNDC9Q8TBE3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNDC9Q8TBE3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNDC9Q8TBE3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNDC9Q8TBE3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNDC9Q8TBE3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNDC9Q8TBE3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNDC9Q8TBE3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNDC9Q8TBE3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNDC9Q8TBE3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNDC9Q8TBE3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNDC9Q8TBE3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNDC9Q8TBE3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNDC9Q8TBE3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNDC9Q8TBE3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNDC9Q8TBE3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC9Q8TBE3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC9Q8TBE3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC9Q8TBE3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC9Q8TBE3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC9Q8TBE3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC9Q8TBE3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC9Q8TBE3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC9Q8TBE3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FNDC9Q8TBE3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FNDC9Q8TBE3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FNDC9Q8TBE3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FNDC9Q8TBE3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FNDC9Q8TBE3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FNDC9Q8TBE3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNDC9Q8TBE3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNDC9Q8TBE3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNDC9Q8TBE3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNDC9Q8TBE3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNDC9Q8TBE3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC9Q8TBE3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC9Q8TBE3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC9Q8TBE3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC9Q8TBE3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC9Q8TBE3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC9Q8TBE3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNDC9Q8TBE3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNDC9Q8TBE3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNDC9Q8TBE3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNDC9Q8TBE3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNDC9Q8TBE3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNDC9Q8TBE3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNDC9Q8TBE3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNDC9Q8TBE3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FNDC9Q8TBE3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FNDC9Q8TBE3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FNDC9Q8TBE3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FNDC9Q8TBE3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FNDC9Q8TBE3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC9Q8TBE3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC9Q8TBE3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC9Q8TBE3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNDC9Q8TBE3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNDC9Q8TBE3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNDC9Q8TBE3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNDC9Q8TBE3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNDC9Q8TBE3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNDC9Q8TBE3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNDC9Q8TBE3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNDC9Q8TBE3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNDC9Q8TBE3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNDC9Q8TBE3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNDC9Q8TBE3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNDC9Q8TBE3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FNDC9Q8TBE3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNDC9Q8TBE3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FNDC9Q8TBE3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms