Protein–RNA interactions for Protein: Q8TA94

ZNF563, Zinc finger protein 563, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF563Q8TA94 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF563Q8TA94 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF563Q8TA94 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF563Q8TA94 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ZNF563Q8TA94 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ZNF563Q8TA94 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ZNF563Q8TA94 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF563Q8TA94 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF563Q8TA94 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF563Q8TA94 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF563Q8TA94 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF563Q8TA94 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF563Q8TA94 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF563Q8TA94 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF563Q8TA94 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF563Q8TA94 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF563Q8TA94 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF563Q8TA94 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF563Q8TA94 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF563Q8TA94 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF563Q8TA94 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF563Q8TA94 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF563Q8TA94 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF563Q8TA94 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF563Q8TA94 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF563Q8TA94 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF563Q8TA94 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF563Q8TA94 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF563Q8TA94 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF563Q8TA94 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF563Q8TA94 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF563Q8TA94 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF563Q8TA94 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF563Q8TA94 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF563Q8TA94 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF563Q8TA94 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF563Q8TA94 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF563Q8TA94 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF563Q8TA94 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF563Q8TA94 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF563Q8TA94 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF563Q8TA94 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF563Q8TA94 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF563Q8TA94 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF563Q8TA94 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF563Q8TA94 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF563Q8TA94 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF563Q8TA94 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF563Q8TA94 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF563Q8TA94 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF563Q8TA94 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF563Q8TA94 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF563Q8TA94 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF563Q8TA94 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF563Q8TA94 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF563Q8TA94 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF563Q8TA94 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF563Q8TA94 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF563Q8TA94 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF563Q8TA94 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF563Q8TA94 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF563Q8TA94 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF563Q8TA94 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF563Q8TA94 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF563Q8TA94 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF563Q8TA94 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF563Q8TA94 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF563Q8TA94 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF563Q8TA94 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF563Q8TA94 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF563Q8TA94 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF563Q8TA94 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF563Q8TA94 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF563Q8TA94 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF563Q8TA94 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF563Q8TA94 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF563Q8TA94 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF563Q8TA94 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF563Q8TA94 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF563Q8TA94 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF563Q8TA94 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF563Q8TA94 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF563Q8TA94 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF563Q8TA94 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF563Q8TA94 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF563Q8TA94 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF563Q8TA94 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF563Q8TA94 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF563Q8TA94 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF563Q8TA94 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF563Q8TA94 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF563Q8TA94 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF563Q8TA94 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF563Q8TA94 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF563Q8TA94 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF563Q8TA94 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF563Q8TA94 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF563Q8TA94 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF563Q8TA94 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF563Q8TA94 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms