Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBW4

SLC38A9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A9Q8NBW4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC38A9Q8NBW4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC38A9Q8NBW4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC38A9Q8NBW4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC38A9Q8NBW4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC38A9Q8NBW4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC38A9Q8NBW4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC38A9Q8NBW4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC38A9Q8NBW4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC38A9Q8NBW4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC38A9Q8NBW4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC38A9Q8NBW4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC38A9Q8NBW4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC38A9Q8NBW4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC38A9Q8NBW4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC38A9Q8NBW4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC38A9Q8NBW4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC38A9Q8NBW4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC38A9Q8NBW4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC38A9Q8NBW4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC38A9Q8NBW4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC38A9Q8NBW4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC38A9Q8NBW4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC38A9Q8NBW4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC38A9Q8NBW4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC38A9Q8NBW4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC38A9Q8NBW4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC38A9Q8NBW4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC38A9Q8NBW4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC38A9Q8NBW4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC38A9Q8NBW4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC38A9Q8NBW4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC38A9Q8NBW4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC38A9Q8NBW4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC38A9Q8NBW4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC38A9Q8NBW4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC38A9Q8NBW4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC38A9Q8NBW4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC38A9Q8NBW4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC38A9Q8NBW4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC38A9Q8NBW4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC38A9Q8NBW4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC38A9Q8NBW4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC38A9Q8NBW4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC38A9Q8NBW4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC38A9Q8NBW4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC38A9Q8NBW4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC38A9Q8NBW4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC38A9Q8NBW4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC38A9Q8NBW4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC38A9Q8NBW4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC38A9Q8NBW4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC38A9Q8NBW4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC38A9Q8NBW4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC38A9Q8NBW4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC38A9Q8NBW4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC38A9Q8NBW4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC38A9Q8NBW4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC38A9Q8NBW4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC38A9Q8NBW4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC38A9Q8NBW4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC38A9Q8NBW4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC38A9Q8NBW4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC38A9Q8NBW4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC38A9Q8NBW4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC38A9Q8NBW4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC38A9Q8NBW4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC38A9Q8NBW4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC38A9Q8NBW4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC38A9Q8NBW4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC38A9Q8NBW4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC38A9Q8NBW4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC38A9Q8NBW4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC38A9Q8NBW4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC38A9Q8NBW4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC38A9Q8NBW4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC38A9Q8NBW4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC38A9Q8NBW4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC38A9Q8NBW4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC38A9Q8NBW4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC38A9Q8NBW4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC38A9Q8NBW4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC38A9Q8NBW4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC38A9Q8NBW4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC38A9Q8NBW4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC38A9Q8NBW4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC38A9Q8NBW4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC38A9Q8NBW4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC38A9Q8NBW4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC38A9Q8NBW4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC38A9Q8NBW4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC38A9Q8NBW4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC38A9Q8NBW4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC38A9Q8NBW4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC38A9Q8NBW4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC38A9Q8NBW4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC38A9Q8NBW4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC38A9Q8NBW4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC38A9Q8NBW4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC38A9Q8NBW4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms