Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9G6

Putative UPF0607 protein FLJ37424, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8N9G6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q8N9G6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q8N9G6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q8N9G6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q8N9G6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q8N9G6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q8N9G6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q8N9G6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q8N9G6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q8N9G6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q8N9G6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q8N9G6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Q8N9G6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q8N9G6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q8N9G6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q8N9G6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q8N9G6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q8N9G6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q8N9G6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Q8N9G6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q8N9G6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q8N9G6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q8N9G6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q8N9G6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q8N9G6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q8N9G6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q8N9G6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Q8N9G6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q8N9G6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q8N9G6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q8N9G6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q8N9G6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q8N9G6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q8N9G6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q8N9G6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q8N9G6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q8N9G6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q8N9G6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q8N9G6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q8N9G6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q8N9G6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q8N9G6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q8N9G6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q8N9G6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q8N9G6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q8N9G6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Q8N9G6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q8N9G6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q8N9G6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q8N9G6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Q8N9G6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q8N9G6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q8N9G6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q8N9G6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q8N9G6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q8N9G6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Q8N9G6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q8N9G6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Q8N9G6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q8N9G6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q8N9G6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q8N9G6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q8N9G6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q8N9G6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q8N9G6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q8N9G6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q8N9G6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q8N9G6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Q8N9G6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q8N9G6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q8N9G6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Q8N9G6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q8N9G6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q8N9G6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Q8N9G6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q8N9G6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q8N9G6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Q8N9G6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q8N9G6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q8N9G6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q8N9G6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q8N9G6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q8N9G6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q8N9G6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q8N9G6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q8N9G6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q8N9G6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q8N9G6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q8N9G6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q8N9G6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Q8N9G6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q8N9G6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q8N9G6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q8N9G6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q8N9G6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q8N9G6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q8N9G6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q8N9G6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q8N9G6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q8N9G6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
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