Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC82Q8N4S0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC82Q8N4S0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC82Q8N4S0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC82Q8N4S0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC82Q8N4S0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC82Q8N4S0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC82Q8N4S0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CCDC82Q8N4S0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC82Q8N4S0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC82Q8N4S0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC82Q8N4S0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC82Q8N4S0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC82Q8N4S0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC82Q8N4S0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC82Q8N4S0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC82Q8N4S0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC82Q8N4S0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC82Q8N4S0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC82Q8N4S0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC82Q8N4S0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC82Q8N4S0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC82Q8N4S0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC82Q8N4S0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC82Q8N4S0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC82Q8N4S0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC82Q8N4S0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC82Q8N4S0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC82Q8N4S0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC82Q8N4S0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC82Q8N4S0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC82Q8N4S0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC82Q8N4S0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC82Q8N4S0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC82Q8N4S0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC82Q8N4S0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC82Q8N4S0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC82Q8N4S0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC82Q8N4S0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC82Q8N4S0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CCDC82Q8N4S0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC82Q8N4S0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC82Q8N4S0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC82Q8N4S0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC82Q8N4S0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC82Q8N4S0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC82Q8N4S0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC82Q8N4S0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC82Q8N4S0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC82Q8N4S0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC82Q8N4S0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC82Q8N4S0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC82Q8N4S0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC82Q8N4S0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC82Q8N4S0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC82Q8N4S0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC82Q8N4S0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC82Q8N4S0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC82Q8N4S0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC82Q8N4S0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC82Q8N4S0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC82Q8N4S0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC82Q8N4S0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC82Q8N4S0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC82Q8N4S0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC82Q8N4S0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC82Q8N4S0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC82Q8N4S0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC82Q8N4S0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC82Q8N4S0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC82Q8N4S0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC82Q8N4S0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC82Q8N4S0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC82Q8N4S0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC82Q8N4S0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC82Q8N4S0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC82Q8N4S0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC82Q8N4S0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC82Q8N4S0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC82Q8N4S0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC82Q8N4S0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC82Q8N4S0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC82Q8N4S0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC82Q8N4S0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC82Q8N4S0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC82Q8N4S0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC82Q8N4S0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC82Q8N4S0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC82Q8N4S0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC82Q8N4S0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC82Q8N4S0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC82Q8N4S0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC82Q8N4S0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC82Q8N4S0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC82Q8N4S0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC82Q8N4S0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC82Q8N4S0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC82Q8N4S0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC82Q8N4S0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC82Q8N4S0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms