Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RAB11FIP4Q86YS3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RAB11FIP4Q86YS3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RAB11FIP4Q86YS3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RAB11FIP4Q86YS3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RAB11FIP4Q86YS3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RAB11FIP4Q86YS3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RAB11FIP4Q86YS3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RAB11FIP4Q86YS3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RAB11FIP4Q86YS3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RAB11FIP4Q86YS3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RAB11FIP4Q86YS3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RAB11FIP4Q86YS3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RAB11FIP4Q86YS3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RAB11FIP4Q86YS3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RAB11FIP4Q86YS3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RAB11FIP4Q86YS3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RAB11FIP4Q86YS3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RAB11FIP4Q86YS3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RAB11FIP4Q86YS3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RAB11FIP4Q86YS3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RAB11FIP4Q86YS3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RAB11FIP4Q86YS3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
RAB11FIP4Q86YS3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RAB11FIP4Q86YS3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RAB11FIP4Q86YS3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RAB11FIP4Q86YS3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RAB11FIP4Q86YS3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RAB11FIP4Q86YS3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
RAB11FIP4Q86YS3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RAB11FIP4Q86YS3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RAB11FIP4Q86YS3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RAB11FIP4Q86YS3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RAB11FIP4Q86YS3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RAB11FIP4Q86YS3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RAB11FIP4Q86YS3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RAB11FIP4Q86YS3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RAB11FIP4Q86YS3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RAB11FIP4Q86YS3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
RAB11FIP4Q86YS3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RAB11FIP4Q86YS3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RAB11FIP4Q86YS3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RAB11FIP4Q86YS3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RAB11FIP4Q86YS3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RAB11FIP4Q86YS3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RAB11FIP4Q86YS3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RAB11FIP4Q86YS3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RAB11FIP4Q86YS3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RAB11FIP4Q86YS3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RAB11FIP4Q86YS3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RAB11FIP4Q86YS3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RAB11FIP4Q86YS3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RAB11FIP4Q86YS3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RAB11FIP4Q86YS3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RAB11FIP4Q86YS3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RAB11FIP4Q86YS3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RAB11FIP4Q86YS3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RAB11FIP4Q86YS3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RAB11FIP4Q86YS3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RAB11FIP4Q86YS3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RAB11FIP4Q86YS3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RAB11FIP4Q86YS3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RAB11FIP4Q86YS3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RAB11FIP4Q86YS3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RAB11FIP4Q86YS3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RAB11FIP4Q86YS3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RAB11FIP4Q86YS3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RAB11FIP4Q86YS3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RAB11FIP4Q86YS3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
RAB11FIP4Q86YS3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RAB11FIP4Q86YS3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RAB11FIP4Q86YS3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RAB11FIP4Q86YS3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RAB11FIP4Q86YS3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RAB11FIP4Q86YS3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RAB11FIP4Q86YS3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RAB11FIP4Q86YS3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RAB11FIP4Q86YS3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RAB11FIP4Q86YS3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RAB11FIP4Q86YS3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RAB11FIP4Q86YS3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RAB11FIP4Q86YS3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RAB11FIP4Q86YS3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RAB11FIP4Q86YS3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RAB11FIP4Q86YS3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RAB11FIP4Q86YS3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RAB11FIP4Q86YS3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RAB11FIP4Q86YS3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RAB11FIP4Q86YS3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RAB11FIP4Q86YS3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RAB11FIP4Q86YS3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
RAB11FIP4Q86YS3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RAB11FIP4Q86YS3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
RAB11FIP4Q86YS3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RAB11FIP4Q86YS3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RAB11FIP4Q86YS3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RAB11FIP4Q86YS3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RAB11FIP4Q86YS3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms