Protein–RNA interactions for Protein: Q86XK3

SFR1, Swi5-dependent recombination DNA repair protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFR1Q86XK3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SFR1Q86XK3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SFR1Q86XK3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SFR1Q86XK3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SFR1Q86XK3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SFR1Q86XK3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SFR1Q86XK3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SFR1Q86XK3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SFR1Q86XK3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SFR1Q86XK3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SFR1Q86XK3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SFR1Q86XK3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SFR1Q86XK3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SFR1Q86XK3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SFR1Q86XK3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SFR1Q86XK3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SFR1Q86XK3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SFR1Q86XK3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SFR1Q86XK3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SFR1Q86XK3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SFR1Q86XK3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SFR1Q86XK3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SFR1Q86XK3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SFR1Q86XK3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SFR1Q86XK3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SFR1Q86XK3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SFR1Q86XK3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SFR1Q86XK3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SFR1Q86XK3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SFR1Q86XK3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SFR1Q86XK3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SFR1Q86XK3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SFR1Q86XK3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SFR1Q86XK3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SFR1Q86XK3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SFR1Q86XK3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SFR1Q86XK3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SFR1Q86XK3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SFR1Q86XK3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SFR1Q86XK3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SFR1Q86XK3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SFR1Q86XK3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SFR1Q86XK3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SFR1Q86XK3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SFR1Q86XK3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SFR1Q86XK3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SFR1Q86XK3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SFR1Q86XK3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SFR1Q86XK3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SFR1Q86XK3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SFR1Q86XK3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SFR1Q86XK3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SFR1Q86XK3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SFR1Q86XK3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SFR1Q86XK3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SFR1Q86XK3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SFR1Q86XK3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SFR1Q86XK3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SFR1Q86XK3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SFR1Q86XK3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SFR1Q86XK3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SFR1Q86XK3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SFR1Q86XK3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SFR1Q86XK3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SFR1Q86XK3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SFR1Q86XK3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SFR1Q86XK3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SFR1Q86XK3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SFR1Q86XK3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SFR1Q86XK3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SFR1Q86XK3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SFR1Q86XK3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SFR1Q86XK3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SFR1Q86XK3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SFR1Q86XK3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SFR1Q86XK3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SFR1Q86XK3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SFR1Q86XK3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SFR1Q86XK3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SFR1Q86XK3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SFR1Q86XK3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SFR1Q86XK3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SFR1Q86XK3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SFR1Q86XK3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SFR1Q86XK3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SFR1Q86XK3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SFR1Q86XK3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SFR1Q86XK3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SFR1Q86XK3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SFR1Q86XK3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SFR1Q86XK3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SFR1Q86XK3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SFR1Q86XK3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SFR1Q86XK3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SFR1Q86XK3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SFR1Q86XK3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SFR1Q86XK3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SFR1Q86XK3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SFR1Q86XK3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SFR1Q86XK3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.1 ms