Protein–RNA interactions for Protein: Q86WP2

GPBP1, Vasculin, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1Q86WP2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GPBP1Q86WP2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GPBP1Q86WP2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GPBP1Q86WP2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GPBP1Q86WP2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GPBP1Q86WP2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GPBP1Q86WP2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GPBP1Q86WP2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPBP1Q86WP2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPBP1Q86WP2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPBP1Q86WP2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GPBP1Q86WP2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GPBP1Q86WP2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GPBP1Q86WP2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
GPBP1Q86WP2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GPBP1Q86WP2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GPBP1Q86WP2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GPBP1Q86WP2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GPBP1Q86WP2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GPBP1Q86WP2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
GPBP1Q86WP2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
GPBP1Q86WP2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GPBP1Q86WP2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GPBP1Q86WP2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GPBP1Q86WP2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GPBP1Q86WP2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GPBP1Q86WP2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GPBP1Q86WP2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GPBP1Q86WP2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GPBP1Q86WP2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GPBP1Q86WP2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
GPBP1Q86WP2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GPBP1Q86WP2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GPBP1Q86WP2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GPBP1Q86WP2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GPBP1Q86WP2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GPBP1Q86WP2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GPBP1Q86WP2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GPBP1Q86WP2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GPBP1Q86WP2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GPBP1Q86WP2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GPBP1Q86WP2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GPBP1Q86WP2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GPBP1Q86WP2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GPBP1Q86WP2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GPBP1Q86WP2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GPBP1Q86WP2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GPBP1Q86WP2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GPBP1Q86WP2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GPBP1Q86WP2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GPBP1Q86WP2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GPBP1Q86WP2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GPBP1Q86WP2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GPBP1Q86WP2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GPBP1Q86WP2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
GPBP1Q86WP2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
GPBP1Q86WP2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GPBP1Q86WP2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GPBP1Q86WP2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GPBP1Q86WP2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GPBP1Q86WP2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GPBP1Q86WP2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GPBP1Q86WP2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GPBP1Q86WP2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GPBP1Q86WP2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GPBP1Q86WP2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GPBP1Q86WP2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GPBP1Q86WP2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GPBP1Q86WP2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GPBP1Q86WP2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GPBP1Q86WP2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GPBP1Q86WP2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GPBP1Q86WP2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GPBP1Q86WP2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GPBP1Q86WP2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GPBP1Q86WP2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GPBP1Q86WP2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GPBP1Q86WP2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GPBP1Q86WP2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GPBP1Q86WP2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GPBP1Q86WP2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GPBP1Q86WP2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GPBP1Q86WP2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GPBP1Q86WP2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GPBP1Q86WP2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GPBP1Q86WP2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GPBP1Q86WP2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GPBP1Q86WP2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GPBP1Q86WP2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GPBP1Q86WP2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GPBP1Q86WP2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GPBP1Q86WP2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GPBP1Q86WP2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
GPBP1Q86WP2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
GPBP1Q86WP2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GPBP1Q86WP2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GPBP1Q86WP2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GPBP1Q86WP2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GPBP1Q86WP2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GPBP1Q86WP2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 651.7 ms