Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC84Q86UT8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC84Q86UT8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC84Q86UT8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC84Q86UT8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC84Q86UT8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC84Q86UT8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC84Q86UT8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC84Q86UT8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC84Q86UT8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC84Q86UT8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC84Q86UT8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC84Q86UT8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC84Q86UT8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC84Q86UT8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC84Q86UT8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC84Q86UT8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC84Q86UT8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC84Q86UT8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC84Q86UT8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC84Q86UT8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC84Q86UT8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC84Q86UT8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC84Q86UT8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC84Q86UT8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC84Q86UT8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC84Q86UT8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC84Q86UT8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCDC84Q86UT8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCDC84Q86UT8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC84Q86UT8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC84Q86UT8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC84Q86UT8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC84Q86UT8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC84Q86UT8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC84Q86UT8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC84Q86UT8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC84Q86UT8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC84Q86UT8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC84Q86UT8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC84Q86UT8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC84Q86UT8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC84Q86UT8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC84Q86UT8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC84Q86UT8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC84Q86UT8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC84Q86UT8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CCDC84Q86UT8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC84Q86UT8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC84Q86UT8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC84Q86UT8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC84Q86UT8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC84Q86UT8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC84Q86UT8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC84Q86UT8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC84Q86UT8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC84Q86UT8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC84Q86UT8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC84Q86UT8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC84Q86UT8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC84Q86UT8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC84Q86UT8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC84Q86UT8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC84Q86UT8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC84Q86UT8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC84Q86UT8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC84Q86UT8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC84Q86UT8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC84Q86UT8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC84Q86UT8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC84Q86UT8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC84Q86UT8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC84Q86UT8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC84Q86UT8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC84Q86UT8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC84Q86UT8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC84Q86UT8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC84Q86UT8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC84Q86UT8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC84Q86UT8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC84Q86UT8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC84Q86UT8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC84Q86UT8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC84Q86UT8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC84Q86UT8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC84Q86UT8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC84Q86UT8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC84Q86UT8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC84Q86UT8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC84Q86UT8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC84Q86UT8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC84Q86UT8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC84Q86UT8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC84Q86UT8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC84Q86UT8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC84Q86UT8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC84Q86UT8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC84Q86UT8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC84Q86UT8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC84Q86UT8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms