Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BHLHA9Q7RTU4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BHLHA9Q7RTU4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
BHLHA9Q7RTU4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BHLHA9Q7RTU4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BHLHA9Q7RTU4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BHLHA9Q7RTU4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BHLHA9Q7RTU4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BHLHA9Q7RTU4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BHLHA9Q7RTU4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BHLHA9Q7RTU4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BHLHA9Q7RTU4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BHLHA9Q7RTU4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BHLHA9Q7RTU4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BHLHA9Q7RTU4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BHLHA9Q7RTU4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BHLHA9Q7RTU4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BHLHA9Q7RTU4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
BHLHA9Q7RTU4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BHLHA9Q7RTU4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BHLHA9Q7RTU4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BHLHA9Q7RTU4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BHLHA9Q7RTU4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BHLHA9Q7RTU4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BHLHA9Q7RTU4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BHLHA9Q7RTU4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BHLHA9Q7RTU4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BHLHA9Q7RTU4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BHLHA9Q7RTU4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BHLHA9Q7RTU4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BHLHA9Q7RTU4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BHLHA9Q7RTU4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BHLHA9Q7RTU4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BHLHA9Q7RTU4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BHLHA9Q7RTU4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BHLHA9Q7RTU4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BHLHA9Q7RTU4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
BHLHA9Q7RTU4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
BHLHA9Q7RTU4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
BHLHA9Q7RTU4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
BHLHA9Q7RTU4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
BHLHA9Q7RTU4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BHLHA9Q7RTU4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BHLHA9Q7RTU4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BHLHA9Q7RTU4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BHLHA9Q7RTU4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BHLHA9Q7RTU4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BHLHA9Q7RTU4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BHLHA9Q7RTU4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BHLHA9Q7RTU4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BHLHA9Q7RTU4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BHLHA9Q7RTU4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BHLHA9Q7RTU4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BHLHA9Q7RTU4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BHLHA9Q7RTU4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BHLHA9Q7RTU4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BHLHA9Q7RTU4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BHLHA9Q7RTU4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BHLHA9Q7RTU4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BHLHA9Q7RTU4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BHLHA9Q7RTU4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
BHLHA9Q7RTU4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
BHLHA9Q7RTU4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
BHLHA9Q7RTU4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BHLHA9Q7RTU4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BHLHA9Q7RTU4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BHLHA9Q7RTU4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BHLHA9Q7RTU4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BHLHA9Q7RTU4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BHLHA9Q7RTU4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BHLHA9Q7RTU4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BHLHA9Q7RTU4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BHLHA9Q7RTU4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BHLHA9Q7RTU4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BHLHA9Q7RTU4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BHLHA9Q7RTU4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BHLHA9Q7RTU4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BHLHA9Q7RTU4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BHLHA9Q7RTU4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BHLHA9Q7RTU4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BHLHA9Q7RTU4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BHLHA9Q7RTU4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
BHLHA9Q7RTU4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BHLHA9Q7RTU4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BHLHA9Q7RTU4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BHLHA9Q7RTU4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BHLHA9Q7RTU4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BHLHA9Q7RTU4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BHLHA9Q7RTU4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BHLHA9Q7RTU4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BHLHA9Q7RTU4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
BHLHA9Q7RTU4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BHLHA9Q7RTU4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BHLHA9Q7RTU4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BHLHA9Q7RTU4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
BHLHA9Q7RTU4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BHLHA9Q7RTU4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BHLHA9Q7RTU4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BHLHA9Q7RTU4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BHLHA9Q7RTU4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms