Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT6

SSX6, Putative protein SSX6, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX6Q7RTT6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSX6Q7RTT6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSX6Q7RTT6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSX6Q7RTT6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSX6Q7RTT6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SSX6Q7RTT6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSX6Q7RTT6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSX6Q7RTT6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSX6Q7RTT6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSX6Q7RTT6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSX6Q7RTT6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SSX6Q7RTT6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SSX6Q7RTT6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SSX6Q7RTT6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSX6Q7RTT6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSX6Q7RTT6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSX6Q7RTT6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSX6Q7RTT6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSX6Q7RTT6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSX6Q7RTT6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSX6Q7RTT6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSX6Q7RTT6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSX6Q7RTT6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSX6Q7RTT6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSX6Q7RTT6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSX6Q7RTT6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SSX6Q7RTT6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSX6Q7RTT6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSX6Q7RTT6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSX6Q7RTT6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSX6Q7RTT6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSX6Q7RTT6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSX6Q7RTT6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSX6Q7RTT6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSX6Q7RTT6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSX6Q7RTT6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSX6Q7RTT6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSX6Q7RTT6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSX6Q7RTT6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSX6Q7RTT6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSX6Q7RTT6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSX6Q7RTT6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSX6Q7RTT6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSX6Q7RTT6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSX6Q7RTT6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSX6Q7RTT6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SSX6Q7RTT6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSX6Q7RTT6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSX6Q7RTT6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SSX6Q7RTT6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSX6Q7RTT6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SSX6Q7RTT6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SSX6Q7RTT6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSX6Q7RTT6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSX6Q7RTT6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSX6Q7RTT6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSX6Q7RTT6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSX6Q7RTT6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSX6Q7RTT6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSX6Q7RTT6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSX6Q7RTT6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSX6Q7RTT6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSX6Q7RTT6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SSX6Q7RTT6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSX6Q7RTT6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SSX6Q7RTT6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSX6Q7RTT6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSX6Q7RTT6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSX6Q7RTT6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSX6Q7RTT6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSX6Q7RTT6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSX6Q7RTT6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SSX6Q7RTT6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSX6Q7RTT6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSX6Q7RTT6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSX6Q7RTT6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSX6Q7RTT6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSX6Q7RTT6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSX6Q7RTT6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSX6Q7RTT6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSX6Q7RTT6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSX6Q7RTT6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSX6Q7RTT6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSX6Q7RTT6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSX6Q7RTT6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSX6Q7RTT6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSX6Q7RTT6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSX6Q7RTT6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSX6Q7RTT6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSX6Q7RTT6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSX6Q7RTT6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSX6Q7RTT6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SSX6Q7RTT6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSX6Q7RTT6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSX6Q7RTT6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSX6Q7RTT6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSX6Q7RTT6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSX6Q7RTT6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSX6Q7RTT6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSX6Q7RTT6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms