Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ3

USP30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP30Q70CQ3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP30Q70CQ3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP30Q70CQ3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP30Q70CQ3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
USP30Q70CQ3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP30Q70CQ3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP30Q70CQ3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
USP30Q70CQ3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP30Q70CQ3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP30Q70CQ3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP30Q70CQ3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP30Q70CQ3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP30Q70CQ3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP30Q70CQ3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP30Q70CQ3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP30Q70CQ3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP30Q70CQ3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP30Q70CQ3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP30Q70CQ3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP30Q70CQ3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP30Q70CQ3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP30Q70CQ3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP30Q70CQ3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP30Q70CQ3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP30Q70CQ3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP30Q70CQ3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP30Q70CQ3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP30Q70CQ3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP30Q70CQ3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
USP30Q70CQ3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP30Q70CQ3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP30Q70CQ3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP30Q70CQ3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP30Q70CQ3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP30Q70CQ3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
USP30Q70CQ3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP30Q70CQ3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP30Q70CQ3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP30Q70CQ3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP30Q70CQ3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP30Q70CQ3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP30Q70CQ3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP30Q70CQ3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP30Q70CQ3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP30Q70CQ3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP30Q70CQ3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP30Q70CQ3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
USP30Q70CQ3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP30Q70CQ3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP30Q70CQ3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP30Q70CQ3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP30Q70CQ3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP30Q70CQ3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP30Q70CQ3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP30Q70CQ3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP30Q70CQ3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP30Q70CQ3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
USP30Q70CQ3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP30Q70CQ3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP30Q70CQ3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP30Q70CQ3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP30Q70CQ3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP30Q70CQ3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP30Q70CQ3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP30Q70CQ3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP30Q70CQ3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP30Q70CQ3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP30Q70CQ3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
USP30Q70CQ3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP30Q70CQ3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP30Q70CQ3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP30Q70CQ3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP30Q70CQ3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP30Q70CQ3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP30Q70CQ3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP30Q70CQ3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP30Q70CQ3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP30Q70CQ3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP30Q70CQ3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
USP30Q70CQ3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP30Q70CQ3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP30Q70CQ3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP30Q70CQ3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP30Q70CQ3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
USP30Q70CQ3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP30Q70CQ3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
USP30Q70CQ3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP30Q70CQ3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
USP30Q70CQ3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP30Q70CQ3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP30Q70CQ3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP30Q70CQ3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP30Q70CQ3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP30Q70CQ3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP30Q70CQ3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP30Q70CQ3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP30Q70CQ3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP30Q70CQ3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP30Q70CQ3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP30Q70CQ3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
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