Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT07

TBC1D9, TBC1 domain family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D9Q6ZT07 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TBC1D9Q6ZT07 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
TBC1D9Q6ZT07 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TBC1D9Q6ZT07 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TBC1D9Q6ZT07 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TBC1D9Q6ZT07 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TBC1D9Q6ZT07 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TBC1D9Q6ZT07 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TBC1D9Q6ZT07 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TBC1D9Q6ZT07 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TBC1D9Q6ZT07 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
TBC1D9Q6ZT07 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
TBC1D9Q6ZT07 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
TBC1D9Q6ZT07 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
TBC1D9Q6ZT07 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC31.2■■■□□ 2.58
TBC1D9Q6ZT07 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
TBC1D9Q6ZT07 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TBC1D9Q6ZT07 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TBC1D9Q6ZT07 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TBC1D9Q6ZT07 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
TBC1D9Q6ZT07 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
TBC1D9Q6ZT07 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
TBC1D9Q6ZT07 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TBC1D9Q6ZT07 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TBC1D9Q6ZT07 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
TBC1D9Q6ZT07 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
TBC1D9Q6ZT07 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
TBC1D9Q6ZT07 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
TBC1D9Q6ZT07 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TBC1D9Q6ZT07 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TBC1D9Q6ZT07 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TBC1D9Q6ZT07 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TBC1D9Q6ZT07 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TBC1D9Q6ZT07 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TBC1D9Q6ZT07 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TBC1D9Q6ZT07 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TBC1D9Q6ZT07 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TBC1D9Q6ZT07 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TBC1D9Q6ZT07 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TBC1D9Q6ZT07 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TBC1D9Q6ZT07 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TBC1D9Q6ZT07 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TBC1D9Q6ZT07 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TBC1D9Q6ZT07 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TBC1D9Q6ZT07 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
TBC1D9Q6ZT07 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
TBC1D9Q6ZT07 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TBC1D9Q6ZT07 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TBC1D9Q6ZT07 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TBC1D9Q6ZT07 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TBC1D9Q6ZT07 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TBC1D9Q6ZT07 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
TBC1D9Q6ZT07 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
TBC1D9Q6ZT07 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TBC1D9Q6ZT07 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TBC1D9Q6ZT07 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
TBC1D9Q6ZT07 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TBC1D9Q6ZT07 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TBC1D9Q6ZT07 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
TBC1D9Q6ZT07 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
TBC1D9Q6ZT07 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TBC1D9Q6ZT07 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TBC1D9Q6ZT07 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TBC1D9Q6ZT07 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TBC1D9Q6ZT07 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TBC1D9Q6ZT07 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TBC1D9Q6ZT07 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TBC1D9Q6ZT07 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TBC1D9Q6ZT07 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TBC1D9Q6ZT07 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TBC1D9Q6ZT07 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TBC1D9Q6ZT07 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TBC1D9Q6ZT07 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TBC1D9Q6ZT07 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TBC1D9Q6ZT07 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TBC1D9Q6ZT07 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TBC1D9Q6ZT07 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TBC1D9Q6ZT07 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TBC1D9Q6ZT07 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TBC1D9Q6ZT07 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TBC1D9Q6ZT07 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.56
TBC1D9Q6ZT07 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TBC1D9Q6ZT07 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
TBC1D9Q6ZT07 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TBC1D9Q6ZT07 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TBC1D9Q6ZT07 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TBC1D9Q6ZT07 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
TBC1D9Q6ZT07 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
TBC1D9Q6ZT07 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC31■■■□□ 2.55
TBC1D9Q6ZT07 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TBC1D9Q6ZT07 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TBC1D9Q6ZT07 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TBC1D9Q6ZT07 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TBC1D9Q6ZT07 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TBC1D9Q6ZT07 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TBC1D9Q6ZT07 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TBC1D9Q6ZT07 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TBC1D9Q6ZT07 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TBC1D9Q6ZT07 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TBC1D9Q6ZT07 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms