Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSA7

LRRC55, Leucine-rich repeat-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC55Q6ZSA7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC55Q6ZSA7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC55Q6ZSA7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC55Q6ZSA7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC55Q6ZSA7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC55Q6ZSA7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC55Q6ZSA7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC55Q6ZSA7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC55Q6ZSA7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC55Q6ZSA7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC55Q6ZSA7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC55Q6ZSA7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC55Q6ZSA7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC55Q6ZSA7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC55Q6ZSA7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC55Q6ZSA7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC55Q6ZSA7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC55Q6ZSA7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
LRRC55Q6ZSA7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC55Q6ZSA7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC55Q6ZSA7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC55Q6ZSA7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC55Q6ZSA7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC55Q6ZSA7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC55Q6ZSA7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC55Q6ZSA7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC55Q6ZSA7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC55Q6ZSA7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC55Q6ZSA7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC55Q6ZSA7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC55Q6ZSA7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC55Q6ZSA7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC55Q6ZSA7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC55Q6ZSA7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC55Q6ZSA7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC55Q6ZSA7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC55Q6ZSA7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC55Q6ZSA7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC55Q6ZSA7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC55Q6ZSA7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC55Q6ZSA7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC55Q6ZSA7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC55Q6ZSA7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC55Q6ZSA7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC55Q6ZSA7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC55Q6ZSA7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC55Q6ZSA7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC55Q6ZSA7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC55Q6ZSA7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC55Q6ZSA7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC55Q6ZSA7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC55Q6ZSA7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC55Q6ZSA7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC55Q6ZSA7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRC55Q6ZSA7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRC55Q6ZSA7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRC55Q6ZSA7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRC55Q6ZSA7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC55Q6ZSA7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC55Q6ZSA7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC55Q6ZSA7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LRRC55Q6ZSA7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRC55Q6ZSA7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC55Q6ZSA7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC55Q6ZSA7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC55Q6ZSA7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC55Q6ZSA7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC55Q6ZSA7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC55Q6ZSA7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC55Q6ZSA7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC55Q6ZSA7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC55Q6ZSA7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC55Q6ZSA7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC55Q6ZSA7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC55Q6ZSA7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC55Q6ZSA7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC55Q6ZSA7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC55Q6ZSA7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC55Q6ZSA7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC55Q6ZSA7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC55Q6ZSA7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC55Q6ZSA7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC55Q6ZSA7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC55Q6ZSA7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC55Q6ZSA7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRRC55Q6ZSA7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRRC55Q6ZSA7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRRC55Q6ZSA7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRRC55Q6ZSA7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
LRRC55Q6ZSA7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRC55Q6ZSA7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRC55Q6ZSA7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRC55Q6ZSA7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRC55Q6ZSA7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRC55Q6ZSA7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC55Q6ZSA7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC55Q6ZSA7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC55Q6ZSA7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC55Q6ZSA7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC55Q6ZSA7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms