Protein–RNA interactions for Protein: Q6YBV0

SLC36A4, Proton-coupled amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A4Q6YBV0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC36A4Q6YBV0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC36A4Q6YBV0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC36A4Q6YBV0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC36A4Q6YBV0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC36A4Q6YBV0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC36A4Q6YBV0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC36A4Q6YBV0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC36A4Q6YBV0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC36A4Q6YBV0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC36A4Q6YBV0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC36A4Q6YBV0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC36A4Q6YBV0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC36A4Q6YBV0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC36A4Q6YBV0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC36A4Q6YBV0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC36A4Q6YBV0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC36A4Q6YBV0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC36A4Q6YBV0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC36A4Q6YBV0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC36A4Q6YBV0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC36A4Q6YBV0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC36A4Q6YBV0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC36A4Q6YBV0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC36A4Q6YBV0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC36A4Q6YBV0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC36A4Q6YBV0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC36A4Q6YBV0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC36A4Q6YBV0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC36A4Q6YBV0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC36A4Q6YBV0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC36A4Q6YBV0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC36A4Q6YBV0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC36A4Q6YBV0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC36A4Q6YBV0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC36A4Q6YBV0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC36A4Q6YBV0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC36A4Q6YBV0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC36A4Q6YBV0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC36A4Q6YBV0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC36A4Q6YBV0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC36A4Q6YBV0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC36A4Q6YBV0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC36A4Q6YBV0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC36A4Q6YBV0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC36A4Q6YBV0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC36A4Q6YBV0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC36A4Q6YBV0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC36A4Q6YBV0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC36A4Q6YBV0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC36A4Q6YBV0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC36A4Q6YBV0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC36A4Q6YBV0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC36A4Q6YBV0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC36A4Q6YBV0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC36A4Q6YBV0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC36A4Q6YBV0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC36A4Q6YBV0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC36A4Q6YBV0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC36A4Q6YBV0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC36A4Q6YBV0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC36A4Q6YBV0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC36A4Q6YBV0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC36A4Q6YBV0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC36A4Q6YBV0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC36A4Q6YBV0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC36A4Q6YBV0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC36A4Q6YBV0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC36A4Q6YBV0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC36A4Q6YBV0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC36A4Q6YBV0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC36A4Q6YBV0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC36A4Q6YBV0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC36A4Q6YBV0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC36A4Q6YBV0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC36A4Q6YBV0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC36A4Q6YBV0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC36A4Q6YBV0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC36A4Q6YBV0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC36A4Q6YBV0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC36A4Q6YBV0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC36A4Q6YBV0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC36A4Q6YBV0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC36A4Q6YBV0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC36A4Q6YBV0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC36A4Q6YBV0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC36A4Q6YBV0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC36A4Q6YBV0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC36A4Q6YBV0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC36A4Q6YBV0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC36A4Q6YBV0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC36A4Q6YBV0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC36A4Q6YBV0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC36A4Q6YBV0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC36A4Q6YBV0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC36A4Q6YBV0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC36A4Q6YBV0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC36A4Q6YBV0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC36A4Q6YBV0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC36A4Q6YBV0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms