Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY18

LINGO4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO4Q6UY18 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LINGO4Q6UY18 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LINGO4Q6UY18 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LINGO4Q6UY18 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LINGO4Q6UY18 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LINGO4Q6UY18 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LINGO4Q6UY18 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LINGO4Q6UY18 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LINGO4Q6UY18 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LINGO4Q6UY18 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LINGO4Q6UY18 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LINGO4Q6UY18 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LINGO4Q6UY18 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LINGO4Q6UY18 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LINGO4Q6UY18 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LINGO4Q6UY18 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LINGO4Q6UY18 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LINGO4Q6UY18 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LINGO4Q6UY18 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LINGO4Q6UY18 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LINGO4Q6UY18 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LINGO4Q6UY18 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LINGO4Q6UY18 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LINGO4Q6UY18 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LINGO4Q6UY18 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LINGO4Q6UY18 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LINGO4Q6UY18 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LINGO4Q6UY18 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LINGO4Q6UY18 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LINGO4Q6UY18 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LINGO4Q6UY18 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LINGO4Q6UY18 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LINGO4Q6UY18 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LINGO4Q6UY18 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
LINGO4Q6UY18 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LINGO4Q6UY18 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LINGO4Q6UY18 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LINGO4Q6UY18 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LINGO4Q6UY18 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LINGO4Q6UY18 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LINGO4Q6UY18 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LINGO4Q6UY18 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LINGO4Q6UY18 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LINGO4Q6UY18 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LINGO4Q6UY18 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LINGO4Q6UY18 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LINGO4Q6UY18 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LINGO4Q6UY18 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LINGO4Q6UY18 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LINGO4Q6UY18 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LINGO4Q6UY18 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LINGO4Q6UY18 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LINGO4Q6UY18 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LINGO4Q6UY18 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LINGO4Q6UY18 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LINGO4Q6UY18 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LINGO4Q6UY18 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LINGO4Q6UY18 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LINGO4Q6UY18 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LINGO4Q6UY18 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LINGO4Q6UY18 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LINGO4Q6UY18 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LINGO4Q6UY18 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LINGO4Q6UY18 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LINGO4Q6UY18 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LINGO4Q6UY18 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LINGO4Q6UY18 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LINGO4Q6UY18 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LINGO4Q6UY18 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LINGO4Q6UY18 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LINGO4Q6UY18 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LINGO4Q6UY18 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LINGO4Q6UY18 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LINGO4Q6UY18 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LINGO4Q6UY18 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LINGO4Q6UY18 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LINGO4Q6UY18 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LINGO4Q6UY18 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LINGO4Q6UY18 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LINGO4Q6UY18 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LINGO4Q6UY18 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LINGO4Q6UY18 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LINGO4Q6UY18 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LINGO4Q6UY18 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
LINGO4Q6UY18 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LINGO4Q6UY18 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LINGO4Q6UY18 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LINGO4Q6UY18 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LINGO4Q6UY18 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
LINGO4Q6UY18 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LINGO4Q6UY18 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
LINGO4Q6UY18 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LINGO4Q6UY18 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LINGO4Q6UY18 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LINGO4Q6UY18 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LINGO4Q6UY18 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LINGO4Q6UY18 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LINGO4Q6UY18 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LINGO4Q6UY18 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LINGO4Q6UY18 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms