Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3S1

DENND1B, DENN domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND1BQ6P3S1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DENND1BQ6P3S1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DENND1BQ6P3S1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DENND1BQ6P3S1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DENND1BQ6P3S1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DENND1BQ6P3S1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DENND1BQ6P3S1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DENND1BQ6P3S1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DENND1BQ6P3S1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DENND1BQ6P3S1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DENND1BQ6P3S1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DENND1BQ6P3S1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DENND1BQ6P3S1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DENND1BQ6P3S1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DENND1BQ6P3S1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
DENND1BQ6P3S1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
DENND1BQ6P3S1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DENND1BQ6P3S1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DENND1BQ6P3S1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DENND1BQ6P3S1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DENND1BQ6P3S1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DENND1BQ6P3S1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DENND1BQ6P3S1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DENND1BQ6P3S1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DENND1BQ6P3S1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DENND1BQ6P3S1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DENND1BQ6P3S1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DENND1BQ6P3S1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DENND1BQ6P3S1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DENND1BQ6P3S1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DENND1BQ6P3S1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DENND1BQ6P3S1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DENND1BQ6P3S1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
DENND1BQ6P3S1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DENND1BQ6P3S1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DENND1BQ6P3S1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DENND1BQ6P3S1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DENND1BQ6P3S1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DENND1BQ6P3S1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DENND1BQ6P3S1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
DENND1BQ6P3S1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DENND1BQ6P3S1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DENND1BQ6P3S1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
DENND1BQ6P3S1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DENND1BQ6P3S1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DENND1BQ6P3S1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DENND1BQ6P3S1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DENND1BQ6P3S1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DENND1BQ6P3S1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DENND1BQ6P3S1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DENND1BQ6P3S1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DENND1BQ6P3S1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DENND1BQ6P3S1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DENND1BQ6P3S1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DENND1BQ6P3S1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DENND1BQ6P3S1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DENND1BQ6P3S1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DENND1BQ6P3S1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DENND1BQ6P3S1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DENND1BQ6P3S1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DENND1BQ6P3S1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DENND1BQ6P3S1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DENND1BQ6P3S1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DENND1BQ6P3S1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DENND1BQ6P3S1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DENND1BQ6P3S1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DENND1BQ6P3S1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DENND1BQ6P3S1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DENND1BQ6P3S1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
DENND1BQ6P3S1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DENND1BQ6P3S1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DENND1BQ6P3S1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DENND1BQ6P3S1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DENND1BQ6P3S1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DENND1BQ6P3S1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DENND1BQ6P3S1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DENND1BQ6P3S1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DENND1BQ6P3S1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DENND1BQ6P3S1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DENND1BQ6P3S1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DENND1BQ6P3S1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DENND1BQ6P3S1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DENND1BQ6P3S1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DENND1BQ6P3S1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DENND1BQ6P3S1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DENND1BQ6P3S1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DENND1BQ6P3S1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DENND1BQ6P3S1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DENND1BQ6P3S1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DENND1BQ6P3S1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DENND1BQ6P3S1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DENND1BQ6P3S1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DENND1BQ6P3S1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DENND1BQ6P3S1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DENND1BQ6P3S1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
DENND1BQ6P3S1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DENND1BQ6P3S1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DENND1BQ6P3S1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DENND1BQ6P3S1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DENND1BQ6P3S1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.8 ms