Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBW4

NCAPH2, Condensin-2 complex subunit H2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPH2Q6IBW4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NCAPH2Q6IBW4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NCAPH2Q6IBW4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NCAPH2Q6IBW4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NCAPH2Q6IBW4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NCAPH2Q6IBW4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NCAPH2Q6IBW4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCAPH2Q6IBW4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCAPH2Q6IBW4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCAPH2Q6IBW4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NCAPH2Q6IBW4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NCAPH2Q6IBW4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NCAPH2Q6IBW4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NCAPH2Q6IBW4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NCAPH2Q6IBW4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NCAPH2Q6IBW4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
NCAPH2Q6IBW4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NCAPH2Q6IBW4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NCAPH2Q6IBW4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NCAPH2Q6IBW4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NCAPH2Q6IBW4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NCAPH2Q6IBW4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NCAPH2Q6IBW4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NCAPH2Q6IBW4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NCAPH2Q6IBW4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NCAPH2Q6IBW4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NCAPH2Q6IBW4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NCAPH2Q6IBW4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NCAPH2Q6IBW4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NCAPH2Q6IBW4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NCAPH2Q6IBW4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NCAPH2Q6IBW4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NCAPH2Q6IBW4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NCAPH2Q6IBW4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NCAPH2Q6IBW4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NCAPH2Q6IBW4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NCAPH2Q6IBW4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NCAPH2Q6IBW4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NCAPH2Q6IBW4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NCAPH2Q6IBW4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NCAPH2Q6IBW4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NCAPH2Q6IBW4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NCAPH2Q6IBW4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NCAPH2Q6IBW4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NCAPH2Q6IBW4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NCAPH2Q6IBW4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NCAPH2Q6IBW4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NCAPH2Q6IBW4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NCAPH2Q6IBW4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NCAPH2Q6IBW4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NCAPH2Q6IBW4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NCAPH2Q6IBW4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NCAPH2Q6IBW4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NCAPH2Q6IBW4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NCAPH2Q6IBW4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NCAPH2Q6IBW4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NCAPH2Q6IBW4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NCAPH2Q6IBW4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NCAPH2Q6IBW4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NCAPH2Q6IBW4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NCAPH2Q6IBW4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NCAPH2Q6IBW4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NCAPH2Q6IBW4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NCAPH2Q6IBW4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NCAPH2Q6IBW4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NCAPH2Q6IBW4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NCAPH2Q6IBW4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NCAPH2Q6IBW4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NCAPH2Q6IBW4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NCAPH2Q6IBW4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NCAPH2Q6IBW4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NCAPH2Q6IBW4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NCAPH2Q6IBW4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NCAPH2Q6IBW4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NCAPH2Q6IBW4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NCAPH2Q6IBW4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NCAPH2Q6IBW4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NCAPH2Q6IBW4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NCAPH2Q6IBW4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NCAPH2Q6IBW4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NCAPH2Q6IBW4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NCAPH2Q6IBW4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NCAPH2Q6IBW4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NCAPH2Q6IBW4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NCAPH2Q6IBW4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NCAPH2Q6IBW4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NCAPH2Q6IBW4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NCAPH2Q6IBW4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NCAPH2Q6IBW4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NCAPH2Q6IBW4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NCAPH2Q6IBW4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NCAPH2Q6IBW4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NCAPH2Q6IBW4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NCAPH2Q6IBW4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NCAPH2Q6IBW4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NCAPH2Q6IBW4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NCAPH2Q6IBW4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NCAPH2Q6IBW4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NCAPH2Q6IBW4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NCAPH2Q6IBW4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms