Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP3

MLIP, Muscular LMNA-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLIPQ5VWP3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MLIPQ5VWP3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MLIPQ5VWP3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MLIPQ5VWP3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MLIPQ5VWP3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MLIPQ5VWP3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MLIPQ5VWP3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MLIPQ5VWP3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MLIPQ5VWP3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MLIPQ5VWP3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MLIPQ5VWP3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MLIPQ5VWP3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MLIPQ5VWP3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MLIPQ5VWP3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MLIPQ5VWP3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MLIPQ5VWP3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MLIPQ5VWP3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MLIPQ5VWP3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MLIPQ5VWP3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MLIPQ5VWP3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MLIPQ5VWP3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MLIPQ5VWP3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MLIPQ5VWP3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MLIPQ5VWP3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MLIPQ5VWP3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MLIPQ5VWP3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MLIPQ5VWP3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MLIPQ5VWP3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MLIPQ5VWP3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MLIPQ5VWP3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MLIPQ5VWP3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MLIPQ5VWP3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MLIPQ5VWP3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MLIPQ5VWP3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MLIPQ5VWP3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MLIPQ5VWP3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MLIPQ5VWP3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MLIPQ5VWP3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MLIPQ5VWP3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MLIPQ5VWP3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MLIPQ5VWP3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MLIPQ5VWP3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MLIPQ5VWP3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MLIPQ5VWP3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MLIPQ5VWP3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MLIPQ5VWP3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MLIPQ5VWP3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MLIPQ5VWP3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MLIPQ5VWP3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MLIPQ5VWP3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MLIPQ5VWP3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MLIPQ5VWP3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MLIPQ5VWP3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MLIPQ5VWP3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MLIPQ5VWP3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MLIPQ5VWP3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MLIPQ5VWP3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MLIPQ5VWP3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MLIPQ5VWP3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MLIPQ5VWP3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MLIPQ5VWP3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MLIPQ5VWP3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MLIPQ5VWP3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
MLIPQ5VWP3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MLIPQ5VWP3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MLIPQ5VWP3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MLIPQ5VWP3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MLIPQ5VWP3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MLIPQ5VWP3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MLIPQ5VWP3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MLIPQ5VWP3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MLIPQ5VWP3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MLIPQ5VWP3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MLIPQ5VWP3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MLIPQ5VWP3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MLIPQ5VWP3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MLIPQ5VWP3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MLIPQ5VWP3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MLIPQ5VWP3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MLIPQ5VWP3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MLIPQ5VWP3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MLIPQ5VWP3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MLIPQ5VWP3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MLIPQ5VWP3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MLIPQ5VWP3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MLIPQ5VWP3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MLIPQ5VWP3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MLIPQ5VWP3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MLIPQ5VWP3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MLIPQ5VWP3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MLIPQ5VWP3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MLIPQ5VWP3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MLIPQ5VWP3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MLIPQ5VWP3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MLIPQ5VWP3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MLIPQ5VWP3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MLIPQ5VWP3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MLIPQ5VWP3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MLIPQ5VWP3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MLIPQ5VWP3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.7 ms