Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2D3

OTUD3, OTU domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD3Q5T2D3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTUD3Q5T2D3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
OTUD3Q5T2D3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTUD3Q5T2D3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTUD3Q5T2D3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTUD3Q5T2D3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
OTUD3Q5T2D3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTUD3Q5T2D3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTUD3Q5T2D3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTUD3Q5T2D3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTUD3Q5T2D3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTUD3Q5T2D3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTUD3Q5T2D3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTUD3Q5T2D3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
OTUD3Q5T2D3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
OTUD3Q5T2D3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
OTUD3Q5T2D3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
OTUD3Q5T2D3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTUD3Q5T2D3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTUD3Q5T2D3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTUD3Q5T2D3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTUD3Q5T2D3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTUD3Q5T2D3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTUD3Q5T2D3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
OTUD3Q5T2D3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTUD3Q5T2D3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTUD3Q5T2D3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTUD3Q5T2D3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTUD3Q5T2D3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
OTUD3Q5T2D3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
OTUD3Q5T2D3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
OTUD3Q5T2D3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
OTUD3Q5T2D3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
OTUD3Q5T2D3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTUD3Q5T2D3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTUD3Q5T2D3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTUD3Q5T2D3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTUD3Q5T2D3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTUD3Q5T2D3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTUD3Q5T2D3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTUD3Q5T2D3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTUD3Q5T2D3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTUD3Q5T2D3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTUD3Q5T2D3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTUD3Q5T2D3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTUD3Q5T2D3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTUD3Q5T2D3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTUD3Q5T2D3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTUD3Q5T2D3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTUD3Q5T2D3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTUD3Q5T2D3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTUD3Q5T2D3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTUD3Q5T2D3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTUD3Q5T2D3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTUD3Q5T2D3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTUD3Q5T2D3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTUD3Q5T2D3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTUD3Q5T2D3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTUD3Q5T2D3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTUD3Q5T2D3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTUD3Q5T2D3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTUD3Q5T2D3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTUD3Q5T2D3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTUD3Q5T2D3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTUD3Q5T2D3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTUD3Q5T2D3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTUD3Q5T2D3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
OTUD3Q5T2D3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTUD3Q5T2D3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTUD3Q5T2D3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTUD3Q5T2D3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTUD3Q5T2D3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
OTUD3Q5T2D3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTUD3Q5T2D3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
OTUD3Q5T2D3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTUD3Q5T2D3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTUD3Q5T2D3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTUD3Q5T2D3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTUD3Q5T2D3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTUD3Q5T2D3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTUD3Q5T2D3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTUD3Q5T2D3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTUD3Q5T2D3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTUD3Q5T2D3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTUD3Q5T2D3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTUD3Q5T2D3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTUD3Q5T2D3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTUD3Q5T2D3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUD3Q5T2D3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUD3Q5T2D3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUD3Q5T2D3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUD3Q5T2D3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUD3Q5T2D3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUD3Q5T2D3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUD3Q5T2D3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUD3Q5T2D3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUD3Q5T2D3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUD3Q5T2D3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUD3Q5T2D3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUD3Q5T2D3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms