Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHYHD1Q5SRE7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PHYHD1Q5SRE7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHYHD1Q5SRE7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHYHD1Q5SRE7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHYHD1Q5SRE7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHYHD1Q5SRE7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHYHD1Q5SRE7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHYHD1Q5SRE7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PHYHD1Q5SRE7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHYHD1Q5SRE7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PHYHD1Q5SRE7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PHYHD1Q5SRE7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PHYHD1Q5SRE7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHYHD1Q5SRE7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHYHD1Q5SRE7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHYHD1Q5SRE7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHYHD1Q5SRE7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHYHD1Q5SRE7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHYHD1Q5SRE7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PHYHD1Q5SRE7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHYHD1Q5SRE7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHYHD1Q5SRE7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PHYHD1Q5SRE7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PHYHD1Q5SRE7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PHYHD1Q5SRE7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHYHD1Q5SRE7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHYHD1Q5SRE7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHYHD1Q5SRE7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHYHD1Q5SRE7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHYHD1Q5SRE7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHYHD1Q5SRE7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHYHD1Q5SRE7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHYHD1Q5SRE7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHYHD1Q5SRE7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHYHD1Q5SRE7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHYHD1Q5SRE7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHYHD1Q5SRE7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHYHD1Q5SRE7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHYHD1Q5SRE7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHYHD1Q5SRE7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PHYHD1Q5SRE7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHYHD1Q5SRE7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHYHD1Q5SRE7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHYHD1Q5SRE7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHYHD1Q5SRE7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHYHD1Q5SRE7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHYHD1Q5SRE7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHYHD1Q5SRE7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHYHD1Q5SRE7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHYHD1Q5SRE7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHYHD1Q5SRE7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHYHD1Q5SRE7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHYHD1Q5SRE7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHYHD1Q5SRE7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHYHD1Q5SRE7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHYHD1Q5SRE7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHYHD1Q5SRE7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PHYHD1Q5SRE7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHYHD1Q5SRE7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHYHD1Q5SRE7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHYHD1Q5SRE7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHYHD1Q5SRE7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHYHD1Q5SRE7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PHYHD1Q5SRE7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHYHD1Q5SRE7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHYHD1Q5SRE7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHYHD1Q5SRE7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHYHD1Q5SRE7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHYHD1Q5SRE7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHYHD1Q5SRE7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHYHD1Q5SRE7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHYHD1Q5SRE7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHYHD1Q5SRE7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHYHD1Q5SRE7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHYHD1Q5SRE7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHYHD1Q5SRE7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHYHD1Q5SRE7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHYHD1Q5SRE7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHYHD1Q5SRE7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHYHD1Q5SRE7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHYHD1Q5SRE7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHYHD1Q5SRE7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHYHD1Q5SRE7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHYHD1Q5SRE7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHYHD1Q5SRE7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHYHD1Q5SRE7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHYHD1Q5SRE7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHYHD1Q5SRE7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHYHD1Q5SRE7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PHYHD1Q5SRE7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHYHD1Q5SRE7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHYHD1Q5SRE7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHYHD1Q5SRE7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHYHD1Q5SRE7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHYHD1Q5SRE7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHYHD1Q5SRE7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHYHD1Q5SRE7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PHYHD1Q5SRE7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 830 ms