Protein–RNA interactions for Protein: Q5JT25

RAB41, Ras-related protein Rab-41, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB41Q5JT25 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAB41Q5JT25 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAB41Q5JT25 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAB41Q5JT25 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAB41Q5JT25 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAB41Q5JT25 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAB41Q5JT25 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAB41Q5JT25 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAB41Q5JT25 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAB41Q5JT25 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAB41Q5JT25 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAB41Q5JT25 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RAB41Q5JT25 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAB41Q5JT25 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAB41Q5JT25 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAB41Q5JT25 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAB41Q5JT25 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAB41Q5JT25 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAB41Q5JT25 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAB41Q5JT25 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAB41Q5JT25 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAB41Q5JT25 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAB41Q5JT25 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB41Q5JT25 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB41Q5JT25 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB41Q5JT25 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB41Q5JT25 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB41Q5JT25 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB41Q5JT25 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB41Q5JT25 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB41Q5JT25 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB41Q5JT25 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB41Q5JT25 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB41Q5JT25 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAB41Q5JT25 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAB41Q5JT25 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAB41Q5JT25 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAB41Q5JT25 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAB41Q5JT25 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAB41Q5JT25 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAB41Q5JT25 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB41Q5JT25 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB41Q5JT25 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB41Q5JT25 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB41Q5JT25 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB41Q5JT25 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB41Q5JT25 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB41Q5JT25 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RAB41Q5JT25 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAB41Q5JT25 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAB41Q5JT25 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAB41Q5JT25 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAB41Q5JT25 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAB41Q5JT25 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
RAB41Q5JT25 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB41Q5JT25 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB41Q5JT25 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB41Q5JT25 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB41Q5JT25 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB41Q5JT25 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB41Q5JT25 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAB41Q5JT25 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAB41Q5JT25 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB41Q5JT25 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB41Q5JT25 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RAB41Q5JT25 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAB41Q5JT25 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAB41Q5JT25 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAB41Q5JT25 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAB41Q5JT25 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAB41Q5JT25 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAB41Q5JT25 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB41Q5JT25 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB41Q5JT25 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB41Q5JT25 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB41Q5JT25 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB41Q5JT25 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB41Q5JT25 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB41Q5JT25 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB41Q5JT25 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB41Q5JT25 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB41Q5JT25 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB41Q5JT25 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB41Q5JT25 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB41Q5JT25 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB41Q5JT25 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB41Q5JT25 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB41Q5JT25 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB41Q5JT25 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB41Q5JT25 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAB41Q5JT25 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAB41Q5JT25 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAB41Q5JT25 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAB41Q5JT25 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAB41Q5JT25 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAB41Q5JT25 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAB41Q5JT25 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RAB41Q5JT25 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAB41Q5JT25 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAB41Q5JT25 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165 ms