Protein–RNA interactions for Protein: Q3MHD2

LSM12, Protein LSM12 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM12Q3MHD2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LSM12Q3MHD2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LSM12Q3MHD2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LSM12Q3MHD2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LSM12Q3MHD2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LSM12Q3MHD2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LSM12Q3MHD2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LSM12Q3MHD2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LSM12Q3MHD2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LSM12Q3MHD2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LSM12Q3MHD2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LSM12Q3MHD2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LSM12Q3MHD2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LSM12Q3MHD2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LSM12Q3MHD2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LSM12Q3MHD2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LSM12Q3MHD2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LSM12Q3MHD2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LSM12Q3MHD2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LSM12Q3MHD2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LSM12Q3MHD2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LSM12Q3MHD2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LSM12Q3MHD2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LSM12Q3MHD2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LSM12Q3MHD2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LSM12Q3MHD2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LSM12Q3MHD2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LSM12Q3MHD2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LSM12Q3MHD2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LSM12Q3MHD2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LSM12Q3MHD2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LSM12Q3MHD2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LSM12Q3MHD2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LSM12Q3MHD2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LSM12Q3MHD2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LSM12Q3MHD2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LSM12Q3MHD2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LSM12Q3MHD2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LSM12Q3MHD2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LSM12Q3MHD2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LSM12Q3MHD2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LSM12Q3MHD2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LSM12Q3MHD2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LSM12Q3MHD2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LSM12Q3MHD2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LSM12Q3MHD2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LSM12Q3MHD2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LSM12Q3MHD2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LSM12Q3MHD2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LSM12Q3MHD2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LSM12Q3MHD2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LSM12Q3MHD2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LSM12Q3MHD2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LSM12Q3MHD2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LSM12Q3MHD2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LSM12Q3MHD2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LSM12Q3MHD2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LSM12Q3MHD2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LSM12Q3MHD2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LSM12Q3MHD2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LSM12Q3MHD2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LSM12Q3MHD2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LSM12Q3MHD2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LSM12Q3MHD2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LSM12Q3MHD2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LSM12Q3MHD2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LSM12Q3MHD2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LSM12Q3MHD2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LSM12Q3MHD2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LSM12Q3MHD2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LSM12Q3MHD2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LSM12Q3MHD2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LSM12Q3MHD2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LSM12Q3MHD2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LSM12Q3MHD2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LSM12Q3MHD2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LSM12Q3MHD2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LSM12Q3MHD2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LSM12Q3MHD2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LSM12Q3MHD2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LSM12Q3MHD2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LSM12Q3MHD2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LSM12Q3MHD2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LSM12Q3MHD2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LSM12Q3MHD2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LSM12Q3MHD2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LSM12Q3MHD2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LSM12Q3MHD2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LSM12Q3MHD2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LSM12Q3MHD2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LSM12Q3MHD2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LSM12Q3MHD2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LSM12Q3MHD2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LSM12Q3MHD2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LSM12Q3MHD2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LSM12Q3MHD2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LSM12Q3MHD2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LSM12Q3MHD2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LSM12Q3MHD2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LSM12Q3MHD2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms