Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ECM1Q16610 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ECM1Q16610 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ECM1Q16610 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ECM1Q16610 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ECM1Q16610 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ECM1Q16610 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ECM1Q16610 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ECM1Q16610 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ECM1Q16610 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ECM1Q16610 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ECM1Q16610 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ECM1Q16610 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ECM1Q16610 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ECM1Q16610 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ECM1Q16610 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ECM1Q16610 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ECM1Q16610 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ECM1Q16610 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ECM1Q16610 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ECM1Q16610 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ECM1Q16610 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ECM1Q16610 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ECM1Q16610 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ECM1Q16610 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ECM1Q16610 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ECM1Q16610 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ECM1Q16610 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ECM1Q16610 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ECM1Q16610 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ECM1Q16610 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ECM1Q16610 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ECM1Q16610 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ECM1Q16610 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ECM1Q16610 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ECM1Q16610 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ECM1Q16610 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ECM1Q16610 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
ECM1Q16610 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ECM1Q16610 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ECM1Q16610 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ECM1Q16610 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ECM1Q16610 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ECM1Q16610 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ECM1Q16610 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ECM1Q16610 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ECM1Q16610 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ECM1Q16610 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ECM1Q16610 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ECM1Q16610 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ECM1Q16610 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ECM1Q16610 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ECM1Q16610 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ECM1Q16610 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ECM1Q16610 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ECM1Q16610 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ECM1Q16610 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ECM1Q16610 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ECM1Q16610 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ECM1Q16610 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ECM1Q16610 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ECM1Q16610 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ECM1Q16610 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ECM1Q16610 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ECM1Q16610 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ECM1Q16610 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ECM1Q16610 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ECM1Q16610 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ECM1Q16610 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ECM1Q16610 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ECM1Q16610 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ECM1Q16610 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ECM1Q16610 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ECM1Q16610 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ECM1Q16610 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ECM1Q16610 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ECM1Q16610 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ECM1Q16610 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ECM1Q16610 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ECM1Q16610 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ECM1Q16610 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ECM1Q16610 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ECM1Q16610 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ECM1Q16610 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ECM1Q16610 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ECM1Q16610 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ECM1Q16610 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ECM1Q16610 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ECM1Q16610 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ECM1Q16610 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ECM1Q16610 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ECM1Q16610 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ECM1Q16610 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ECM1Q16610 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ECM1Q16610 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ECM1Q16610 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ECM1Q16610 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ECM1Q16610 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ECM1Q16610 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ECM1Q16610 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
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