Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRNA6Q15825 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRNA6Q15825 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRNA6Q15825 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRNA6Q15825 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHRNA6Q15825 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRNA6Q15825 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRNA6Q15825 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRNA6Q15825 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRNA6Q15825 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRNA6Q15825 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRNA6Q15825 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRNA6Q15825 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRNA6Q15825 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRNA6Q15825 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CHRNA6Q15825 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHRNA6Q15825 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHRNA6Q15825 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CHRNA6Q15825 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHRNA6Q15825 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHRNA6Q15825 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHRNA6Q15825 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRNA6Q15825 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRNA6Q15825 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRNA6Q15825 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRNA6Q15825 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRNA6Q15825 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNA6Q15825 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNA6Q15825 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNA6Q15825 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNA6Q15825 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNA6Q15825 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNA6Q15825 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNA6Q15825 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNA6Q15825 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNA6Q15825 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNA6Q15825 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNA6Q15825 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNA6Q15825 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNA6Q15825 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNA6Q15825 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNA6Q15825 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CHRNA6Q15825 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNA6Q15825 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNA6Q15825 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNA6Q15825 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNA6Q15825 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNA6Q15825 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNA6Q15825 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNA6Q15825 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNA6Q15825 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNA6Q15825 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNA6Q15825 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNA6Q15825 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNA6Q15825 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNA6Q15825 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNA6Q15825 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNA6Q15825 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNA6Q15825 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNA6Q15825 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNA6Q15825 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNA6Q15825 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CHRNA6Q15825 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNA6Q15825 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNA6Q15825 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNA6Q15825 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNA6Q15825 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNA6Q15825 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNA6Q15825 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNA6Q15825 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNA6Q15825 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNA6Q15825 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNA6Q15825 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNA6Q15825 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNA6Q15825 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNA6Q15825 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNA6Q15825 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNA6Q15825 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNA6Q15825 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNA6Q15825 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNA6Q15825 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNA6Q15825 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNA6Q15825 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNA6Q15825 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNA6Q15825 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNA6Q15825 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNA6Q15825 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNA6Q15825 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNA6Q15825 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRNA6Q15825 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRNA6Q15825 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRNA6Q15825 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
CHRNA6Q15825 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRNA6Q15825 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRNA6Q15825 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRNA6Q15825 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRNA6Q15825 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRNA6Q15825 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRNA6Q15825 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRNA6Q15825 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
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