Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDH18Q13634 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDH18Q13634 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDH18Q13634 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDH18Q13634 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDH18Q13634 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDH18Q13634 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDH18Q13634 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDH18Q13634 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDH18Q13634 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDH18Q13634 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDH18Q13634 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDH18Q13634 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDH18Q13634 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDH18Q13634 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDH18Q13634 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDH18Q13634 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
CDH18Q13634 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDH18Q13634 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDH18Q13634 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CDH18Q13634 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDH18Q13634 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDH18Q13634 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDH18Q13634 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDH18Q13634 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDH18Q13634 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDH18Q13634 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDH18Q13634 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDH18Q13634 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CDH18Q13634 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDH18Q13634 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDH18Q13634 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDH18Q13634 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDH18Q13634 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDH18Q13634 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDH18Q13634 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDH18Q13634 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDH18Q13634 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDH18Q13634 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDH18Q13634 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDH18Q13634 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDH18Q13634 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDH18Q13634 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDH18Q13634 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDH18Q13634 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDH18Q13634 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDH18Q13634 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDH18Q13634 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDH18Q13634 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDH18Q13634 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDH18Q13634 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDH18Q13634 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDH18Q13634 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CDH18Q13634 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDH18Q13634 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDH18Q13634 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDH18Q13634 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDH18Q13634 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDH18Q13634 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDH18Q13634 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDH18Q13634 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDH18Q13634 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDH18Q13634 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDH18Q13634 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDH18Q13634 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDH18Q13634 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDH18Q13634 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDH18Q13634 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDH18Q13634 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDH18Q13634 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDH18Q13634 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDH18Q13634 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDH18Q13634 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDH18Q13634 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CDH18Q13634 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDH18Q13634 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDH18Q13634 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDH18Q13634 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDH18Q13634 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDH18Q13634 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDH18Q13634 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDH18Q13634 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDH18Q13634 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDH18Q13634 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDH18Q13634 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CDH18Q13634 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDH18Q13634 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDH18Q13634 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CDH18Q13634 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDH18Q13634 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CDH18Q13634 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDH18Q13634 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDH18Q13634 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDH18Q13634 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDH18Q13634 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CDH18Q13634 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDH18Q13634 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDH18Q13634 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDH18Q13634 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDH18Q13634 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
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