Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NPRL3Q12980 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPRL3Q12980 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPRL3Q12980 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPRL3Q12980 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPRL3Q12980 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPRL3Q12980 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPRL3Q12980 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPRL3Q12980 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPRL3Q12980 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPRL3Q12980 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPRL3Q12980 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPRL3Q12980 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPRL3Q12980 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPRL3Q12980 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPRL3Q12980 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPRL3Q12980 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPRL3Q12980 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPRL3Q12980 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPRL3Q12980 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPRL3Q12980 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NPRL3Q12980 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NPRL3Q12980 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NPRL3Q12980 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NPRL3Q12980 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NPRL3Q12980 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPRL3Q12980 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPRL3Q12980 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPRL3Q12980 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPRL3Q12980 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPRL3Q12980 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPRL3Q12980 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPRL3Q12980 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPRL3Q12980 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPRL3Q12980 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPRL3Q12980 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPRL3Q12980 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPRL3Q12980 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPRL3Q12980 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPRL3Q12980 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPRL3Q12980 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPRL3Q12980 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPRL3Q12980 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPRL3Q12980 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPRL3Q12980 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPRL3Q12980 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPRL3Q12980 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPRL3Q12980 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NPRL3Q12980 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NPRL3Q12980 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NPRL3Q12980 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NPRL3Q12980 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NPRL3Q12980 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NPRL3Q12980 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NPRL3Q12980 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPRL3Q12980 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPRL3Q12980 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPRL3Q12980 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NPRL3Q12980 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NPRL3Q12980 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NPRL3Q12980 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NPRL3Q12980 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NPRL3Q12980 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NPRL3Q12980 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPRL3Q12980 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPRL3Q12980 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPRL3Q12980 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPRL3Q12980 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPRL3Q12980 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPRL3Q12980 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPRL3Q12980 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NPRL3Q12980 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NPRL3Q12980 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NPRL3Q12980 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NPRL3Q12980 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NPRL3Q12980 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPRL3Q12980 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NPRL3Q12980 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPRL3Q12980 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPRL3Q12980 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPRL3Q12980 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPRL3Q12980 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPRL3Q12980 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPRL3Q12980 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPRL3Q12980 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPRL3Q12980 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPRL3Q12980 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPRL3Q12980 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NPRL3Q12980 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NPRL3Q12980 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NPRL3Q12980 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NPRL3Q12980 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NPRL3Q12980 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NPRL3Q12980 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPRL3Q12980 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPRL3Q12980 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPRL3Q12980 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPRL3Q12980 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPRL3Q12980 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPRL3Q12980 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
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