Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRJQ12913 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRJQ12913 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PTPRJQ12913 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRJQ12913 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRJQ12913 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRJQ12913 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRJQ12913 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRJQ12913 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRJQ12913 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRJQ12913 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRJQ12913 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRJQ12913 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRJQ12913 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRJQ12913 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRJQ12913 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRJQ12913 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRJQ12913 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRJQ12913 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRJQ12913 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRJQ12913 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRJQ12913 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRJQ12913 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRJQ12913 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRJQ12913 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRJQ12913 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRJQ12913 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRJQ12913 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRJQ12913 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRJQ12913 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRJQ12913 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRJQ12913 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRJQ12913 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRJQ12913 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRJQ12913 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRJQ12913 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRJQ12913 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRJQ12913 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRJQ12913 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRJQ12913 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRJQ12913 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRJQ12913 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRJQ12913 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRJQ12913 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRJQ12913 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRJQ12913 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRJQ12913 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRJQ12913 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRJQ12913 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTPRJQ12913 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTPRJQ12913 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRJQ12913 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRJQ12913 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRJQ12913 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRJQ12913 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRJQ12913 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRJQ12913 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRJQ12913 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRJQ12913 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRJQ12913 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRJQ12913 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRJQ12913 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRJQ12913 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRJQ12913 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRJQ12913 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRJQ12913 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRJQ12913 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRJQ12913 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRJQ12913 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRJQ12913 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRJQ12913 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRJQ12913 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRJQ12913 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPRJQ12913 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPRJQ12913 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPRJQ12913 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPRJQ12913 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPRJQ12913 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRJQ12913 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRJQ12913 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRJQ12913 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRJQ12913 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRJQ12913 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRJQ12913 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRJQ12913 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRJQ12913 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRJQ12913 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRJQ12913 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRJQ12913 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRJQ12913 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRJQ12913 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRJQ12913 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRJQ12913 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRJQ12913 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRJQ12913 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRJQ12913 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRJQ12913 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRJQ12913 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRJQ12913 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRJQ12913 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
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