Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
APOBRQ0VD83 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
APOBRQ0VD83 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
APOBRQ0VD83 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
APOBRQ0VD83 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
APOBRQ0VD83 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
APOBRQ0VD83 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
APOBRQ0VD83 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
APOBRQ0VD83 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
APOBRQ0VD83 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
APOBRQ0VD83 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
APOBRQ0VD83 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
APOBRQ0VD83 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
APOBRQ0VD83 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
APOBRQ0VD83 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
APOBRQ0VD83 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
APOBRQ0VD83 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
APOBRQ0VD83 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
APOBRQ0VD83 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
APOBRQ0VD83 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
APOBRQ0VD83 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
APOBRQ0VD83 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
APOBRQ0VD83 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
APOBRQ0VD83 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
APOBRQ0VD83 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
APOBRQ0VD83 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
APOBRQ0VD83 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
APOBRQ0VD83 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
APOBRQ0VD83 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
APOBRQ0VD83 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
APOBRQ0VD83 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
APOBRQ0VD83 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
APOBRQ0VD83 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
APOBRQ0VD83 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
APOBRQ0VD83 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
APOBRQ0VD83 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
APOBRQ0VD83 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
APOBRQ0VD83 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
APOBRQ0VD83 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
APOBRQ0VD83 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
APOBRQ0VD83 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
APOBRQ0VD83 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
APOBRQ0VD83 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
APOBRQ0VD83 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
APOBRQ0VD83 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
APOBRQ0VD83 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
APOBRQ0VD83 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
APOBRQ0VD83 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
APOBRQ0VD83 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
APOBRQ0VD83 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
APOBRQ0VD83 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
APOBRQ0VD83 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
APOBRQ0VD83 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
APOBRQ0VD83 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
APOBRQ0VD83 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
APOBRQ0VD83 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
APOBRQ0VD83 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
APOBRQ0VD83 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
APOBRQ0VD83 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
APOBRQ0VD83 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
APOBRQ0VD83 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
APOBRQ0VD83 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
APOBRQ0VD83 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
APOBRQ0VD83 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
APOBRQ0VD83 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
APOBRQ0VD83 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
APOBRQ0VD83 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
APOBRQ0VD83 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
APOBRQ0VD83 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
APOBRQ0VD83 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
APOBRQ0VD83 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
APOBRQ0VD83 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
APOBRQ0VD83 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
APOBRQ0VD83 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
APOBRQ0VD83 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
APOBRQ0VD83 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
APOBRQ0VD83 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
APOBRQ0VD83 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
APOBRQ0VD83 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
APOBRQ0VD83 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
APOBRQ0VD83 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
APOBRQ0VD83 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
APOBRQ0VD83 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
APOBRQ0VD83 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
APOBRQ0VD83 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
APOBRQ0VD83 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
APOBRQ0VD83 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
APOBRQ0VD83 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
APOBRQ0VD83 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
APOBRQ0VD83 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
APOBRQ0VD83 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
APOBRQ0VD83 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
APOBRQ0VD83 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
APOBRQ0VD83 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
APOBRQ0VD83 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
APOBRQ0VD83 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
APOBRQ0VD83 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
APOBRQ0VD83 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
APOBRQ0VD83 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
APOBRQ0VD83 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms