Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
LOXL1Q08397 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LOXL1Q08397 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LOXL1Q08397 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LOXL1Q08397 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LOXL1Q08397 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LOXL1Q08397 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LOXL1Q08397 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LOXL1Q08397 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LOXL1Q08397 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21■□□□□ 0.95
LOXL1Q08397 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
LOXL1Q08397 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LOXL1Q08397 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
LOXL1Q08397 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LOXL1Q08397 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LOXL1Q08397 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LOXL1Q08397 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LOXL1Q08397 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LOXL1Q08397 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LOXL1Q08397 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LOXL1Q08397 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LOXL1Q08397 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LOXL1Q08397 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LOXL1Q08397 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LOXL1Q08397 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LOXL1Q08397 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LOXL1Q08397 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LOXL1Q08397 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LOXL1Q08397 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LOXL1Q08397 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LOXL1Q08397 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
LOXL1Q08397 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LOXL1Q08397 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LOXL1Q08397 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LOXL1Q08397 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
LOXL1Q08397 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LOXL1Q08397 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LOXL1Q08397 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LOXL1Q08397 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LOXL1Q08397 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LOXL1Q08397 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LOXL1Q08397 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LOXL1Q08397 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LOXL1Q08397 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LOXL1Q08397 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LOXL1Q08397 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LOXL1Q08397 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LOXL1Q08397 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LOXL1Q08397 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LOXL1Q08397 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LOXL1Q08397 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
LOXL1Q08397 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LOXL1Q08397 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LOXL1Q08397 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LOXL1Q08397 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LOXL1Q08397 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LOXL1Q08397 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
LOXL1Q08397 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LOXL1Q08397 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LOXL1Q08397 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LOXL1Q08397 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LOXL1Q08397 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LOXL1Q08397 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LOXL1Q08397 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
LOXL1Q08397 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LOXL1Q08397 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
LOXL1Q08397 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LOXL1Q08397 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LOXL1Q08397 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LOXL1Q08397 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LOXL1Q08397 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LOXL1Q08397 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LOXL1Q08397 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LOXL1Q08397 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
LOXL1Q08397 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
LOXL1Q08397 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LOXL1Q08397 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LOXL1Q08397 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LOXL1Q08397 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LOXL1Q08397 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LOXL1Q08397 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LOXL1Q08397 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LOXL1Q08397 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LOXL1Q08397 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LOXL1Q08397 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LOXL1Q08397 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LOXL1Q08397 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LOXL1Q08397 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LOXL1Q08397 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LOXL1Q08397 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LOXL1Q08397 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LOXL1Q08397 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
LOXL1Q08397 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LOXL1Q08397 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LOXL1Q08397 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LOXL1Q08397 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LOXL1Q08397 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LOXL1Q08397 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
LOXL1Q08397 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LOXL1Q08397 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms