Protein–RNA interactions for Protein: Q00604

NDP, Norrin, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDPQ00604 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NDPQ00604 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NDPQ00604 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NDPQ00604 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NDPQ00604 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NDPQ00604 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NDPQ00604 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NDPQ00604 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NDPQ00604 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NDPQ00604 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NDPQ00604 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NDPQ00604 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NDPQ00604 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NDPQ00604 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NDPQ00604 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NDPQ00604 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NDPQ00604 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NDPQ00604 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NDPQ00604 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NDPQ00604 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NDPQ00604 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NDPQ00604 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NDPQ00604 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NDPQ00604 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NDPQ00604 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NDPQ00604 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NDPQ00604 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NDPQ00604 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NDPQ00604 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NDPQ00604 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NDPQ00604 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NDPQ00604 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NDPQ00604 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NDPQ00604 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NDPQ00604 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NDPQ00604 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NDPQ00604 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NDPQ00604 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NDPQ00604 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NDPQ00604 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NDPQ00604 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NDPQ00604 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NDPQ00604 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NDPQ00604 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NDPQ00604 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NDPQ00604 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NDPQ00604 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NDPQ00604 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NDPQ00604 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NDPQ00604 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NDPQ00604 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NDPQ00604 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NDPQ00604 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NDPQ00604 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NDPQ00604 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NDPQ00604 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NDPQ00604 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NDPQ00604 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NDPQ00604 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NDPQ00604 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NDPQ00604 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NDPQ00604 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NDPQ00604 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NDPQ00604 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NDPQ00604 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NDPQ00604 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NDPQ00604 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NDPQ00604 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NDPQ00604 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NDPQ00604 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NDPQ00604 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NDPQ00604 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NDPQ00604 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NDPQ00604 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NDPQ00604 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NDPQ00604 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NDPQ00604 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NDPQ00604 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NDPQ00604 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NDPQ00604 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NDPQ00604 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
NDPQ00604 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NDPQ00604 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NDPQ00604 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NDPQ00604 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NDPQ00604 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NDPQ00604 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NDPQ00604 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NDPQ00604 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NDPQ00604 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NDPQ00604 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NDPQ00604 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NDPQ00604 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NDPQ00604 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NDPQ00604 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NDPQ00604 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NDPQ00604 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NDPQ00604 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NDPQ00604 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
NDPQ00604 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms