Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H3F3AP84243 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
H3F3AP84243 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H3F3AP84243 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H3F3AP84243 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
H3F3AP84243 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H3F3AP84243 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H3F3AP84243 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
H3F3AP84243 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H3F3AP84243 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H3F3AP84243 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H3F3AP84243 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H3F3AP84243 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H3F3AP84243 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H3F3AP84243 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H3F3AP84243 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
H3F3AP84243 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H3F3AP84243 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H3F3AP84243 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H3F3AP84243 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H3F3AP84243 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H3F3AP84243 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H3F3AP84243 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H3F3AP84243 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H3F3AP84243 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H3F3AP84243 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H3F3AP84243 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H3F3AP84243 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
H3F3AP84243 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3F3AP84243 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
H3F3AP84243 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3F3AP84243 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3F3AP84243 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3F3AP84243 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3F3AP84243 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3F3AP84243 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3F3AP84243 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H3F3AP84243 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H3F3AP84243 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H3F3AP84243 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H3F3AP84243 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H3F3AP84243 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
H3F3AP84243 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H3F3AP84243 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H3F3AP84243 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
H3F3AP84243 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H3F3AP84243 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H3F3AP84243 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H3F3AP84243 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H3F3AP84243 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H3F3AP84243 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H3F3AP84243 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H3F3AP84243 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H3F3AP84243 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
H3F3AP84243 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H3F3AP84243 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H3F3AP84243 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H3F3AP84243 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H3F3AP84243 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H3F3AP84243 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H3F3AP84243 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H3F3AP84243 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H3F3AP84243 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3F3AP84243 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3F3AP84243 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3F3AP84243 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3F3AP84243 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3F3AP84243 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3F3AP84243 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3F3AP84243 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3F3AP84243 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3F3AP84243 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
H3F3AP84243 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3F3AP84243 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3F3AP84243 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3F3AP84243 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3F3AP84243 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3F3AP84243 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3F3AP84243 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3F3AP84243 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3F3AP84243 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3F3AP84243 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3F3AP84243 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3F3AP84243 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3F3AP84243 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3F3AP84243 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H3F3AP84243 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H3F3AP84243 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H3F3AP84243 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3F3AP84243 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3F3AP84243 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3F3AP84243 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3F3AP84243 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3F3AP84243 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3F3AP84243 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
H3F3AP84243 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3F3AP84243 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3F3AP84243 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H3F3AP84243 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H3F3AP84243 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms