Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
COG7P83436 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
COG7P83436 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COG7P83436 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
COG7P83436 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
COG7P83436 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COG7P83436 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
COG7P83436 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
COG7P83436 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
COG7P83436 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
COG7P83436 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
COG7P83436 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
COG7P83436 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
COG7P83436 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
COG7P83436 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
COG7P83436 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
COG7P83436 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
COG7P83436 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
COG7P83436 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
COG7P83436 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
COG7P83436 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
COG7P83436 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
COG7P83436 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
COG7P83436 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
COG7P83436 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
COG7P83436 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
COG7P83436 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
COG7P83436 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
COG7P83436 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
COG7P83436 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
COG7P83436 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
COG7P83436 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
COG7P83436 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
COG7P83436 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
COG7P83436 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
COG7P83436 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
COG7P83436 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
COG7P83436 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
COG7P83436 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
COG7P83436 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
COG7P83436 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
COG7P83436 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
COG7P83436 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
COG7P83436 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
COG7P83436 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
COG7P83436 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
COG7P83436 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
COG7P83436 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
COG7P83436 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
COG7P83436 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
COG7P83436 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
COG7P83436 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
COG7P83436 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
COG7P83436 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
COG7P83436 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
COG7P83436 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
COG7P83436 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
COG7P83436 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
COG7P83436 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
COG7P83436 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
COG7P83436 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
COG7P83436 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
COG7P83436 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
COG7P83436 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
COG7P83436 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
COG7P83436 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
COG7P83436 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
COG7P83436 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
COG7P83436 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
COG7P83436 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
COG7P83436 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
COG7P83436 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
COG7P83436 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
COG7P83436 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
COG7P83436 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
COG7P83436 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
COG7P83436 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
COG7P83436 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
COG7P83436 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
COG7P83436 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
COG7P83436 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
COG7P83436 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
COG7P83436 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
COG7P83436 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
COG7P83436 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
COG7P83436 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
COG7P83436 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
COG7P83436 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
COG7P83436 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
COG7P83436 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
COG7P83436 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COG7P83436 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COG7P83436 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COG7P83436 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
COG7P83436 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
COG7P83436 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COG7P83436 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COG7P83436 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
COG7P83436 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COG7P83436 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms