Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERVPABLB-1P60509 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERVPABLB-1P60509 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERVPABLB-1P60509 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERVPABLB-1P60509 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERVPABLB-1P60509 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERVPABLB-1P60509 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERVPABLB-1P60509 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERVPABLB-1P60509 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERVPABLB-1P60509 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVPABLB-1P60509 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVPABLB-1P60509 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVPABLB-1P60509 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVPABLB-1P60509 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVPABLB-1P60509 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVPABLB-1P60509 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVPABLB-1P60509 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVPABLB-1P60509 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVPABLB-1P60509 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVPABLB-1P60509 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVPABLB-1P60509 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERVPABLB-1P60509 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERVPABLB-1P60509 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERVPABLB-1P60509 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERVPABLB-1P60509 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERVPABLB-1P60509 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERVPABLB-1P60509 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERVPABLB-1P60509 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERVPABLB-1P60509 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ERVPABLB-1P60509 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ERVPABLB-1P60509 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVPABLB-1P60509 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVPABLB-1P60509 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVPABLB-1P60509 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVPABLB-1P60509 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVPABLB-1P60509 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVPABLB-1P60509 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVPABLB-1P60509 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVPABLB-1P60509 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVPABLB-1P60509 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVPABLB-1P60509 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVPABLB-1P60509 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVPABLB-1P60509 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVPABLB-1P60509 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVPABLB-1P60509 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVPABLB-1P60509 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVPABLB-1P60509 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVPABLB-1P60509 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVPABLB-1P60509 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERVPABLB-1P60509 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERVPABLB-1P60509 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERVPABLB-1P60509 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERVPABLB-1P60509 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERVPABLB-1P60509 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERVPABLB-1P60509 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ERVPABLB-1P60509 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVPABLB-1P60509 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVPABLB-1P60509 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVPABLB-1P60509 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVPABLB-1P60509 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVPABLB-1P60509 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVPABLB-1P60509 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVPABLB-1P60509 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVPABLB-1P60509 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVPABLB-1P60509 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVPABLB-1P60509 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVPABLB-1P60509 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVPABLB-1P60509 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ERVPABLB-1P60509 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERVPABLB-1P60509 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERVPABLB-1P60509 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERVPABLB-1P60509 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERVPABLB-1P60509 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERVPABLB-1P60509 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERVPABLB-1P60509 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVPABLB-1P60509 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVPABLB-1P60509 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVPABLB-1P60509 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERVPABLB-1P60509 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERVPABLB-1P60509 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ERVPABLB-1P60509 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERVPABLB-1P60509 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERVPABLB-1P60509 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERVPABLB-1P60509 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERVPABLB-1P60509 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERVPABLB-1P60509 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERVPABLB-1P60509 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERVPABLB-1P60509 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVPABLB-1P60509 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVPABLB-1P60509 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVPABLB-1P60509 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVPABLB-1P60509 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVPABLB-1P60509 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVPABLB-1P60509 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVPABLB-1P60509 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVPABLB-1P60509 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVPABLB-1P60509 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVPABLB-1P60509 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVPABLB-1P60509 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVPABLB-1P60509 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms