Protein–RNA interactions for Protein: P56856

CLDN18, Claudin-18, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN18P56856 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN18P56856 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN18P56856 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN18P56856 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN18P56856 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN18P56856 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN18P56856 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN18P56856 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN18P56856 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN18P56856 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN18P56856 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN18P56856 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN18P56856 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN18P56856 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN18P56856 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLDN18P56856 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLDN18P56856 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLDN18P56856 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN18P56856 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN18P56856 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN18P56856 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN18P56856 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN18P56856 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN18P56856 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN18P56856 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN18P56856 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN18P56856 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN18P56856 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN18P56856 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN18P56856 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN18P56856 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN18P56856 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN18P56856 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN18P56856 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN18P56856 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN18P56856 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN18P56856 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN18P56856 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN18P56856 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN18P56856 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN18P56856 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN18P56856 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN18P56856 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN18P56856 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN18P56856 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN18P56856 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN18P56856 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN18P56856 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN18P56856 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN18P56856 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN18P56856 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN18P56856 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN18P56856 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN18P56856 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN18P56856 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN18P56856 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN18P56856 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN18P56856 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN18P56856 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN18P56856 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN18P56856 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN18P56856 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN18P56856 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN18P56856 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN18P56856 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN18P56856 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN18P56856 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN18P56856 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN18P56856 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN18P56856 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN18P56856 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN18P56856 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN18P56856 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN18P56856 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN18P56856 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN18P56856 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN18P56856 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN18P56856 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN18P56856 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN18P56856 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN18P56856 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN18P56856 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN18P56856 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN18P56856 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN18P56856 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN18P56856 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN18P56856 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN18P56856 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN18P56856 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN18P56856 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN18P56856 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN18P56856 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN18P56856 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN18P56856 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN18P56856 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN18P56856 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN18P56856 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN18P56856 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN18P56856 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN18P56856 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms