Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GFRA1P56159 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GFRA1P56159 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GFRA1P56159 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GFRA1P56159 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GFRA1P56159 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GFRA1P56159 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GFRA1P56159 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GFRA1P56159 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GFRA1P56159 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GFRA1P56159 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GFRA1P56159 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GFRA1P56159 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GFRA1P56159 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GFRA1P56159 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GFRA1P56159 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GFRA1P56159 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GFRA1P56159 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GFRA1P56159 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GFRA1P56159 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GFRA1P56159 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GFRA1P56159 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GFRA1P56159 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GFRA1P56159 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GFRA1P56159 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GFRA1P56159 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GFRA1P56159 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GFRA1P56159 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GFRA1P56159 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GFRA1P56159 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GFRA1P56159 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GFRA1P56159 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GFRA1P56159 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GFRA1P56159 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GFRA1P56159 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GFRA1P56159 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GFRA1P56159 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GFRA1P56159 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GFRA1P56159 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GFRA1P56159 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GFRA1P56159 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GFRA1P56159 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GFRA1P56159 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GFRA1P56159 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GFRA1P56159 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GFRA1P56159 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GFRA1P56159 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GFRA1P56159 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GFRA1P56159 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GFRA1P56159 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GFRA1P56159 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GFRA1P56159 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GFRA1P56159 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GFRA1P56159 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GFRA1P56159 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GFRA1P56159 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GFRA1P56159 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GFRA1P56159 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GFRA1P56159 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GFRA1P56159 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GFRA1P56159 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GFRA1P56159 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GFRA1P56159 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GFRA1P56159 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GFRA1P56159 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GFRA1P56159 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GFRA1P56159 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GFRA1P56159 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GFRA1P56159 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GFRA1P56159 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GFRA1P56159 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GFRA1P56159 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GFRA1P56159 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GFRA1P56159 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GFRA1P56159 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GFRA1P56159 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GFRA1P56159 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GFRA1P56159 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GFRA1P56159 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GFRA1P56159 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GFRA1P56159 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GFRA1P56159 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GFRA1P56159 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GFRA1P56159 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GFRA1P56159 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GFRA1P56159 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GFRA1P56159 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GFRA1P56159 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GFRA1P56159 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GFRA1P56159 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GFRA1P56159 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GFRA1P56159 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GFRA1P56159 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GFRA1P56159 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GFRA1P56159 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GFRA1P56159 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GFRA1P56159 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GFRA1P56159 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GFRA1P56159 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GFRA1P56159 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.8 ms