Protein–RNA interactions for Protein: P55036

PSMD4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD4P55036 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMD4P55036 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMD4P55036 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMD4P55036 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMD4P55036 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMD4P55036 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMD4P55036 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMD4P55036 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMD4P55036 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMD4P55036 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD4P55036 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD4P55036 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD4P55036 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD4P55036 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD4P55036 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD4P55036 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD4P55036 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD4P55036 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD4P55036 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD4P55036 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD4P55036 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD4P55036 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD4P55036 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD4P55036 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD4P55036 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD4P55036 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD4P55036 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD4P55036 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMD4P55036 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMD4P55036 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMD4P55036 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMD4P55036 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMD4P55036 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMD4P55036 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMD4P55036 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMD4P55036 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMD4P55036 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMD4P55036 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMD4P55036 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMD4P55036 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMD4P55036 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMD4P55036 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMD4P55036 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMD4P55036 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD4P55036 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD4P55036 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD4P55036 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD4P55036 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD4P55036 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD4P55036 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD4P55036 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMD4P55036 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMD4P55036 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMD4P55036 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD4P55036 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD4P55036 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD4P55036 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD4P55036 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD4P55036 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD4P55036 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD4P55036 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD4P55036 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD4P55036 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD4P55036 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD4P55036 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD4P55036 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD4P55036 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD4P55036 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD4P55036 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD4P55036 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD4P55036 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD4P55036 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD4P55036 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMD4P55036 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMD4P55036 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMD4P55036 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMD4P55036 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMD4P55036 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMD4P55036 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMD4P55036 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMD4P55036 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD4P55036 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD4P55036 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD4P55036 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD4P55036 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMD4P55036 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMD4P55036 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMD4P55036 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMD4P55036 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMD4P55036 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMD4P55036 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMD4P55036 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMD4P55036 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMD4P55036 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSMD4P55036 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSMD4P55036 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSMD4P55036 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMD4P55036 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMD4P55036 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMD4P55036 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms