Protein–RNA interactions for Protein: P52435

POLR2J, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2JP52435 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2JP52435 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2JP52435 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR2JP52435 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR2JP52435 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR2JP52435 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR2JP52435 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2JP52435 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2JP52435 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2JP52435 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2JP52435 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2JP52435 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2JP52435 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR2JP52435 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR2JP52435 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR2JP52435 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
POLR2JP52435 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR2JP52435 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR2JP52435 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
POLR2JP52435 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR2JP52435 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
POLR2JP52435 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR2JP52435 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR2JP52435 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR2JP52435 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR2JP52435 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR2JP52435 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR2JP52435 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR2JP52435 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR2JP52435 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR2JP52435 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR2JP52435 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR2JP52435 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR2JP52435 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2JP52435 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2JP52435 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2JP52435 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2JP52435 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
POLR2JP52435 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
POLR2JP52435 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR2JP52435 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2JP52435 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2JP52435 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2JP52435 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2JP52435 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR2JP52435 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR2JP52435 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR2JP52435 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR2JP52435 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR2JP52435 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR2JP52435 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR2JP52435 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR2JP52435 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR2JP52435 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR2JP52435 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR2JP52435 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLR2JP52435 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR2JP52435 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR2JP52435 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR2JP52435 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR2JP52435 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR2JP52435 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR2JP52435 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR2JP52435 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR2JP52435 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR2JP52435 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR2JP52435 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR2JP52435 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR2JP52435 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR2JP52435 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR2JP52435 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR2JP52435 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR2JP52435 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR2JP52435 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR2JP52435 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR2JP52435 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR2JP52435 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR2JP52435 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR2JP52435 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR2JP52435 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR2JP52435 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR2JP52435 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR2JP52435 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR2JP52435 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR2JP52435 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR2JP52435 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR2JP52435 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR2JP52435 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR2JP52435 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR2JP52435 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR2JP52435 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR2JP52435 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR2JP52435 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
POLR2JP52435 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
POLR2JP52435 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR2JP52435 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR2JP52435 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR2JP52435 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR2JP52435 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR2JP52435 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms