Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE2E1P51965 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE2E1P51965 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE2E1P51965 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE2E1P51965 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE2E1P51965 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE2E1P51965 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE2E1P51965 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE2E1P51965 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE2E1P51965 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE2E1P51965 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE2E1P51965 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE2E1P51965 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE2E1P51965 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE2E1P51965 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE2E1P51965 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE2E1P51965 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE2E1P51965 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE2E1P51965 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE2E1P51965 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE2E1P51965 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE2E1P51965 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE2E1P51965 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE2E1P51965 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE2E1P51965 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE2E1P51965 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE2E1P51965 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE2E1P51965 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE2E1P51965 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE2E1P51965 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE2E1P51965 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE2E1P51965 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE2E1P51965 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE2E1P51965 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE2E1P51965 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE2E1P51965 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE2E1P51965 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE2E1P51965 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE2E1P51965 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE2E1P51965 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE2E1P51965 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE2E1P51965 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE2E1P51965 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE2E1P51965 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE2E1P51965 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE2E1P51965 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE2E1P51965 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE2E1P51965 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE2E1P51965 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE2E1P51965 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE2E1P51965 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE2E1P51965 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE2E1P51965 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE2E1P51965 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE2E1P51965 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE2E1P51965 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE2E1P51965 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE2E1P51965 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE2E1P51965 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE2E1P51965 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE2E1P51965 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE2E1P51965 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE2E1P51965 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE2E1P51965 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE2E1P51965 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE2E1P51965 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE2E1P51965 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE2E1P51965 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE2E1P51965 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE2E1P51965 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE2E1P51965 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBE2E1P51965 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBE2E1P51965 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBE2E1P51965 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBE2E1P51965 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBE2E1P51965 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
UBE2E1P51965 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
UBE2E1P51965 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBE2E1P51965 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBE2E1P51965 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE2E1P51965 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE2E1P51965 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE2E1P51965 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE2E1P51965 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE2E1P51965 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE2E1P51965 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE2E1P51965 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBE2E1P51965 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBE2E1P51965 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBE2E1P51965 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBE2E1P51965 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
UBE2E1P51965 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBE2E1P51965 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBE2E1P51965 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE2E1P51965 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE2E1P51965 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE2E1P51965 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE2E1P51965 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE2E1P51965 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE2E1P51965 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms