Protein–RNA interactions for Protein: P51878

CASP5, Caspase-5, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP5P51878 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CASP5P51878 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CASP5P51878 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CASP5P51878 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CASP5P51878 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CASP5P51878 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CASP5P51878 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CASP5P51878 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CASP5P51878 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CASP5P51878 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CASP5P51878 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CASP5P51878 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CASP5P51878 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CASP5P51878 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CASP5P51878 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CASP5P51878 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CASP5P51878 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CASP5P51878 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CASP5P51878 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CASP5P51878 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CASP5P51878 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CASP5P51878 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CASP5P51878 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CASP5P51878 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CASP5P51878 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CASP5P51878 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CASP5P51878 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CASP5P51878 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CASP5P51878 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CASP5P51878 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CASP5P51878 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CASP5P51878 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CASP5P51878 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CASP5P51878 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CASP5P51878 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CASP5P51878 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CASP5P51878 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CASP5P51878 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CASP5P51878 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CASP5P51878 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CASP5P51878 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CASP5P51878 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CASP5P51878 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CASP5P51878 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CASP5P51878 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CASP5P51878 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CASP5P51878 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CASP5P51878 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CASP5P51878 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CASP5P51878 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CASP5P51878 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CASP5P51878 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CASP5P51878 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CASP5P51878 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CASP5P51878 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CASP5P51878 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CASP5P51878 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CASP5P51878 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CASP5P51878 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CASP5P51878 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CASP5P51878 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CASP5P51878 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CASP5P51878 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CASP5P51878 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CASP5P51878 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CASP5P51878 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CASP5P51878 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CASP5P51878 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CASP5P51878 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CASP5P51878 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CASP5P51878 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CASP5P51878 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CASP5P51878 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CASP5P51878 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CASP5P51878 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CASP5P51878 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CASP5P51878 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CASP5P51878 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CASP5P51878 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CASP5P51878 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CASP5P51878 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CASP5P51878 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CASP5P51878 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CASP5P51878 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CASP5P51878 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CASP5P51878 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CASP5P51878 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CASP5P51878 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CASP5P51878 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CASP5P51878 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CASP5P51878 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CASP5P51878 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CASP5P51878 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CASP5P51878 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CASP5P51878 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CASP5P51878 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CASP5P51878 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CASP5P51878 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CASP5P51878 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CASP5P51878 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms