Protein–RNA interactions for Protein: P51610

HCFC1, Host cell factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCFC1P51610 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HCFC1P51610 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HCFC1P51610 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HCFC1P51610 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HCFC1P51610 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HCFC1P51610 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HCFC1P51610 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HCFC1P51610 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HCFC1P51610 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HCFC1P51610 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HCFC1P51610 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HCFC1P51610 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HCFC1P51610 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HCFC1P51610 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HCFC1P51610 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HCFC1P51610 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HCFC1P51610 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HCFC1P51610 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HCFC1P51610 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HCFC1P51610 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HCFC1P51610 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HCFC1P51610 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HCFC1P51610 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HCFC1P51610 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HCFC1P51610 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HCFC1P51610 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HCFC1P51610 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HCFC1P51610 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HCFC1P51610 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HCFC1P51610 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HCFC1P51610 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HCFC1P51610 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HCFC1P51610 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HCFC1P51610 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HCFC1P51610 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HCFC1P51610 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HCFC1P51610 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HCFC1P51610 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HCFC1P51610 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HCFC1P51610 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HCFC1P51610 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HCFC1P51610 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HCFC1P51610 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HCFC1P51610 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HCFC1P51610 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HCFC1P51610 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HCFC1P51610 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HCFC1P51610 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HCFC1P51610 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HCFC1P51610 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HCFC1P51610 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HCFC1P51610 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HCFC1P51610 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HCFC1P51610 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HCFC1P51610 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HCFC1P51610 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HCFC1P51610 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HCFC1P51610 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HCFC1P51610 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HCFC1P51610 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HCFC1P51610 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HCFC1P51610 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HCFC1P51610 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HCFC1P51610 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HCFC1P51610 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HCFC1P51610 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HCFC1P51610 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HCFC1P51610 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HCFC1P51610 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HCFC1P51610 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HCFC1P51610 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HCFC1P51610 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HCFC1P51610 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HCFC1P51610 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HCFC1P51610 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HCFC1P51610 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HCFC1P51610 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HCFC1P51610 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HCFC1P51610 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HCFC1P51610 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HCFC1P51610 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HCFC1P51610 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HCFC1P51610 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HCFC1P51610 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HCFC1P51610 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HCFC1P51610 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HCFC1P51610 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HCFC1P51610 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HCFC1P51610 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HCFC1P51610 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HCFC1P51610 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HCFC1P51610 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HCFC1P51610 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HCFC1P51610 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HCFC1P51610 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HCFC1P51610 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HCFC1P51610 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HCFC1P51610 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HCFC1P51610 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HCFC1P51610 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms