Protein–RNA interactions for Protein: P50897

PPT1, Palmitoyl-protein thioesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPT1P50897 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPT1P50897 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPT1P50897 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPT1P50897 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPT1P50897 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPT1P50897 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPT1P50897 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPT1P50897 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPT1P50897 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPT1P50897 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPT1P50897 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPT1P50897 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPT1P50897 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPT1P50897 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPT1P50897 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPT1P50897 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPT1P50897 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPT1P50897 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPT1P50897 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPT1P50897 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPT1P50897 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPT1P50897 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPT1P50897 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPT1P50897 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPT1P50897 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPT1P50897 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPT1P50897 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPT1P50897 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPT1P50897 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPT1P50897 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPT1P50897 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPT1P50897 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPT1P50897 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPT1P50897 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PPT1P50897 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPT1P50897 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPT1P50897 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPT1P50897 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPT1P50897 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPT1P50897 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPT1P50897 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPT1P50897 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPT1P50897 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPT1P50897 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPT1P50897 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPT1P50897 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPT1P50897 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPT1P50897 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPT1P50897 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPT1P50897 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PPT1P50897 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PPT1P50897 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PPT1P50897 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PPT1P50897 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PPT1P50897 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PPT1P50897 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PPT1P50897 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PPT1P50897 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PPT1P50897 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PPT1P50897 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PPT1P50897 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
PPT1P50897 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PPT1P50897 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PPT1P50897 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PPT1P50897 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PPT1P50897 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PPT1P50897 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PPT1P50897 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PPT1P50897 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PPT1P50897 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PPT1P50897 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PPT1P50897 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PPT1P50897 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
PPT1P50897 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PPT1P50897 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PPT1P50897 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PPT1P50897 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PPT1P50897 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PPT1P50897 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PPT1P50897 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PPT1P50897 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PPT1P50897 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PPT1P50897 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PPT1P50897 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PPT1P50897 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PPT1P50897 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PPT1P50897 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PPT1P50897 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PPT1P50897 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PPT1P50897 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PPT1P50897 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PPT1P50897 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PPT1P50897 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PPT1P50897 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PPT1P50897 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PPT1P50897 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PPT1P50897 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PPT1P50897 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PPT1P50897 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PPT1P50897 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms