Protein–RNA interactions for Protein: P48443

RXRG, Retinoic acid receptor RXR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRGP48443 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RXRGP48443 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RXRGP48443 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RXRGP48443 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RXRGP48443 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RXRGP48443 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RXRGP48443 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RXRGP48443 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RXRGP48443 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RXRGP48443 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RXRGP48443 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RXRGP48443 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RXRGP48443 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RXRGP48443 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RXRGP48443 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RXRGP48443 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RXRGP48443 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RXRGP48443 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RXRGP48443 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RXRGP48443 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RXRGP48443 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RXRGP48443 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RXRGP48443 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RXRGP48443 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RXRGP48443 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RXRGP48443 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RXRGP48443 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RXRGP48443 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RXRGP48443 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RXRGP48443 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RXRGP48443 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RXRGP48443 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RXRGP48443 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RXRGP48443 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RXRGP48443 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RXRGP48443 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RXRGP48443 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RXRGP48443 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RXRGP48443 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RXRGP48443 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RXRGP48443 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RXRGP48443 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RXRGP48443 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RXRGP48443 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RXRGP48443 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RXRGP48443 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RXRGP48443 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RXRGP48443 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RXRGP48443 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RXRGP48443 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RXRGP48443 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RXRGP48443 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RXRGP48443 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RXRGP48443 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RXRGP48443 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RXRGP48443 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RXRGP48443 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RXRGP48443 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RXRGP48443 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RXRGP48443 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RXRGP48443 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RXRGP48443 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RXRGP48443 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RXRGP48443 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RXRGP48443 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RXRGP48443 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RXRGP48443 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RXRGP48443 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RXRGP48443 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RXRGP48443 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RXRGP48443 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RXRGP48443 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RXRGP48443 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RXRGP48443 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RXRGP48443 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RXRGP48443 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RXRGP48443 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RXRGP48443 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RXRGP48443 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RXRGP48443 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RXRGP48443 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RXRGP48443 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RXRGP48443 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RXRGP48443 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RXRGP48443 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RXRGP48443 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RXRGP48443 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RXRGP48443 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RXRGP48443 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RXRGP48443 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RXRGP48443 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RXRGP48443 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RXRGP48443 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RXRGP48443 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RXRGP48443 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RXRGP48443 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RXRGP48443 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RXRGP48443 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RXRGP48443 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RXRGP48443 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms