Protein–RNA interactions for Protein: P46778

RPL21, 60S ribosomal protein L21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL21P46778 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPL21P46778 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPL21P46778 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPL21P46778 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPL21P46778 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPL21P46778 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPL21P46778 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPL21P46778 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPL21P46778 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPL21P46778 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPL21P46778 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPL21P46778 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPL21P46778 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPL21P46778 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPL21P46778 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPL21P46778 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPL21P46778 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPL21P46778 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPL21P46778 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPL21P46778 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
RPL21P46778 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPL21P46778 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPL21P46778 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPL21P46778 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPL21P46778 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPL21P46778 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RPL21P46778 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPL21P46778 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPL21P46778 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPL21P46778 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPL21P46778 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPL21P46778 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPL21P46778 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPL21P46778 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPL21P46778 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPL21P46778 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPL21P46778 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPL21P46778 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPL21P46778 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPL21P46778 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPL21P46778 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPL21P46778 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPL21P46778 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RPL21P46778 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPL21P46778 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPL21P46778 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPL21P46778 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPL21P46778 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPL21P46778 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPL21P46778 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPL21P46778 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPL21P46778 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPL21P46778 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RPL21P46778 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RPL21P46778 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPL21P46778 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPL21P46778 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPL21P46778 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPL21P46778 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPL21P46778 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPL21P46778 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPL21P46778 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPL21P46778 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPL21P46778 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPL21P46778 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPL21P46778 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPL21P46778 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPL21P46778 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RPL21P46778 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPL21P46778 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RPL21P46778 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPL21P46778 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPL21P46778 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPL21P46778 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPL21P46778 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPL21P46778 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RPL21P46778 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPL21P46778 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPL21P46778 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RPL21P46778 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RPL21P46778 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RPL21P46778 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPL21P46778 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPL21P46778 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPL21P46778 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPL21P46778 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPL21P46778 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPL21P46778 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPL21P46778 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPL21P46778 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPL21P46778 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPL21P46778 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPL21P46778 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPL21P46778 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPL21P46778 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RPL21P46778 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RPL21P46778 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPL21P46778 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPL21P46778 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPL21P46778 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms