Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHRNA4P43681 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHRNA4P43681 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHRNA4P43681 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHRNA4P43681 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHRNA4P43681 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHRNA4P43681 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRNA4P43681 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRNA4P43681 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRNA4P43681 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRNA4P43681 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRNA4P43681 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRNA4P43681 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHRNA4P43681 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHRNA4P43681 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRNA4P43681 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRNA4P43681 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRNA4P43681 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRNA4P43681 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRNA4P43681 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRNA4P43681 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHRNA4P43681 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHRNA4P43681 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHRNA4P43681 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHRNA4P43681 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHRNA4P43681 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHRNA4P43681 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CHRNA4P43681 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHRNA4P43681 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRNA4P43681 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRNA4P43681 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRNA4P43681 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRNA4P43681 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRNA4P43681 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRNA4P43681 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRNA4P43681 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRNA4P43681 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRNA4P43681 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRNA4P43681 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRNA4P43681 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRNA4P43681 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHRNA4P43681 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHRNA4P43681 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHRNA4P43681 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHRNA4P43681 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHRNA4P43681 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHRNA4P43681 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHRNA4P43681 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHRNA4P43681 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CHRNA4P43681 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRNA4P43681 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRNA4P43681 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRNA4P43681 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRNA4P43681 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRNA4P43681 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CHRNA4P43681 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CHRNA4P43681 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHRNA4P43681 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRNA4P43681 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRNA4P43681 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRNA4P43681 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRNA4P43681 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRNA4P43681 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNA4P43681 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNA4P43681 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNA4P43681 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNA4P43681 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNA4P43681 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNA4P43681 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNA4P43681 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNA4P43681 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNA4P43681 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNA4P43681 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHRNA4P43681 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHRNA4P43681 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHRNA4P43681 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHRNA4P43681 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHRNA4P43681 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHRNA4P43681 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHRNA4P43681 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNA4P43681 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNA4P43681 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNA4P43681 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNA4P43681 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNA4P43681 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNA4P43681 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNA4P43681 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNA4P43681 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNA4P43681 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNA4P43681 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNA4P43681 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNA4P43681 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNA4P43681 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNA4P43681 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRNA4P43681 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRNA4P43681 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRNA4P43681 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRNA4P43681 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRNA4P43681 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRNA4P43681 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms