Protein–RNA interactions for Protein: P43355

MAGEA1, Melanoma-associated antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA1P43355 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
MAGEA1P43355 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
MAGEA1P43355 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MAGEA1P43355 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MAGEA1P43355 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MAGEA1P43355 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MAGEA1P43355 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MAGEA1P43355 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MAGEA1P43355 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MAGEA1P43355 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MAGEA1P43355 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MAGEA1P43355 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MAGEA1P43355 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MAGEA1P43355 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
MAGEA1P43355 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MAGEA1P43355 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
MAGEA1P43355 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MAGEA1P43355 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MAGEA1P43355 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MAGEA1P43355 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MAGEA1P43355 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MAGEA1P43355 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
MAGEA1P43355 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MAGEA1P43355 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MAGEA1P43355 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MAGEA1P43355 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MAGEA1P43355 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MAGEA1P43355 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
MAGEA1P43355 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MAGEA1P43355 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MAGEA1P43355 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MAGEA1P43355 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MAGEA1P43355 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MAGEA1P43355 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MAGEA1P43355 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MAGEA1P43355 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MAGEA1P43355 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MAGEA1P43355 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MAGEA1P43355 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MAGEA1P43355 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MAGEA1P43355 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MAGEA1P43355 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MAGEA1P43355 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MAGEA1P43355 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MAGEA1P43355 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
MAGEA1P43355 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MAGEA1P43355 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MAGEA1P43355 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MAGEA1P43355 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MAGEA1P43355 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MAGEA1P43355 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MAGEA1P43355 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MAGEA1P43355 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MAGEA1P43355 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MAGEA1P43355 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
MAGEA1P43355 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MAGEA1P43355 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MAGEA1P43355 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MAGEA1P43355 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MAGEA1P43355 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MAGEA1P43355 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MAGEA1P43355 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MAGEA1P43355 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MAGEA1P43355 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MAGEA1P43355 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MAGEA1P43355 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MAGEA1P43355 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MAGEA1P43355 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MAGEA1P43355 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MAGEA1P43355 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MAGEA1P43355 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MAGEA1P43355 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
MAGEA1P43355 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MAGEA1P43355 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MAGEA1P43355 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MAGEA1P43355 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MAGEA1P43355 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MAGEA1P43355 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MAGEA1P43355 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MAGEA1P43355 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MAGEA1P43355 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MAGEA1P43355 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MAGEA1P43355 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MAGEA1P43355 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MAGEA1P43355 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MAGEA1P43355 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
MAGEA1P43355 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MAGEA1P43355 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MAGEA1P43355 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MAGEA1P43355 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MAGEA1P43355 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MAGEA1P43355 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MAGEA1P43355 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MAGEA1P43355 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MAGEA1P43355 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
MAGEA1P43355 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MAGEA1P43355 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MAGEA1P43355 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MAGEA1P43355 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MAGEA1P43355 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms