Protein–RNA interactions for Protein: P43234

CTSO, Cathepsin O, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSOP43234 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTSOP43234 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTSOP43234 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTSOP43234 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTSOP43234 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTSOP43234 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTSOP43234 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTSOP43234 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTSOP43234 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTSOP43234 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTSOP43234 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTSOP43234 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTSOP43234 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTSOP43234 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTSOP43234 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTSOP43234 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTSOP43234 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CTSOP43234 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTSOP43234 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTSOP43234 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTSOP43234 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTSOP43234 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTSOP43234 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTSOP43234 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTSOP43234 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTSOP43234 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTSOP43234 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTSOP43234 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTSOP43234 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTSOP43234 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTSOP43234 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CTSOP43234 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTSOP43234 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTSOP43234 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTSOP43234 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTSOP43234 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTSOP43234 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTSOP43234 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTSOP43234 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTSOP43234 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTSOP43234 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTSOP43234 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTSOP43234 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CTSOP43234 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTSOP43234 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTSOP43234 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTSOP43234 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTSOP43234 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTSOP43234 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTSOP43234 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTSOP43234 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTSOP43234 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTSOP43234 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CTSOP43234 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTSOP43234 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CTSOP43234 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CTSOP43234 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTSOP43234 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTSOP43234 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTSOP43234 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTSOP43234 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTSOP43234 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTSOP43234 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTSOP43234 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTSOP43234 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTSOP43234 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTSOP43234 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTSOP43234 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTSOP43234 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTSOP43234 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTSOP43234 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTSOP43234 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTSOP43234 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTSOP43234 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTSOP43234 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTSOP43234 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTSOP43234 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTSOP43234 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CTSOP43234 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CTSOP43234 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CTSOP43234 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTSOP43234 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTSOP43234 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTSOP43234 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTSOP43234 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTSOP43234 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTSOP43234 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTSOP43234 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTSOP43234 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTSOP43234 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTSOP43234 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTSOP43234 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTSOP43234 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CTSOP43234 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTSOP43234 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTSOP43234 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTSOP43234 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTSOP43234 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTSOP43234 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTSOP43234 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms