Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPA3P35244 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPA3P35244 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPA3P35244 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPA3P35244 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPA3P35244 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPA3P35244 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPA3P35244 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPA3P35244 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPA3P35244 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPA3P35244 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RPA3P35244 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPA3P35244 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPA3P35244 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPA3P35244 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPA3P35244 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPA3P35244 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPA3P35244 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPA3P35244 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RPA3P35244 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPA3P35244 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPA3P35244 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPA3P35244 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RPA3P35244 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPA3P35244 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPA3P35244 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RPA3P35244 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPA3P35244 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPA3P35244 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPA3P35244 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPA3P35244 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPA3P35244 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPA3P35244 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPA3P35244 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPA3P35244 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPA3P35244 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPA3P35244 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPA3P35244 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPA3P35244 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPA3P35244 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPA3P35244 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPA3P35244 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPA3P35244 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPA3P35244 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPA3P35244 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPA3P35244 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPA3P35244 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPA3P35244 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPA3P35244 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPA3P35244 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPA3P35244 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPA3P35244 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPA3P35244 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPA3P35244 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPA3P35244 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPA3P35244 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPA3P35244 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPA3P35244 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPA3P35244 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPA3P35244 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPA3P35244 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPA3P35244 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPA3P35244 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPA3P35244 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPA3P35244 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPA3P35244 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPA3P35244 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPA3P35244 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPA3P35244 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPA3P35244 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPA3P35244 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPA3P35244 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPA3P35244 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPA3P35244 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPA3P35244 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPA3P35244 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPA3P35244 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPA3P35244 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPA3P35244 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPA3P35244 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPA3P35244 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPA3P35244 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPA3P35244 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPA3P35244 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPA3P35244 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPA3P35244 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPA3P35244 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RPA3P35244 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPA3P35244 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPA3P35244 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPA3P35244 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPA3P35244 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPA3P35244 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPA3P35244 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPA3P35244 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPA3P35244 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPA3P35244 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RPA3P35244 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPA3P35244 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPA3P35244 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms