Protein–RNA interactions for Protein: P33947

KDELR2, ER lumen protein-retaining receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR2P33947 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KDELR2P33947 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDELR2P33947 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDELR2P33947 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KDELR2P33947 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDELR2P33947 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDELR2P33947 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDELR2P33947 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDELR2P33947 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KDELR2P33947 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDELR2P33947 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KDELR2P33947 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KDELR2P33947 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDELR2P33947 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDELR2P33947 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDELR2P33947 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDELR2P33947 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDELR2P33947 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDELR2P33947 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDELR2P33947 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDELR2P33947 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDELR2P33947 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDELR2P33947 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDELR2P33947 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDELR2P33947 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KDELR2P33947 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDELR2P33947 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDELR2P33947 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDELR2P33947 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDELR2P33947 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDELR2P33947 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDELR2P33947 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDELR2P33947 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDELR2P33947 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDELR2P33947 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDELR2P33947 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KDELR2P33947 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDELR2P33947 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KDELR2P33947 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDELR2P33947 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDELR2P33947 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDELR2P33947 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDELR2P33947 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDELR2P33947 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDELR2P33947 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDELR2P33947 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDELR2P33947 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KDELR2P33947 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDELR2P33947 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDELR2P33947 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDELR2P33947 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDELR2P33947 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDELR2P33947 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDELR2P33947 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDELR2P33947 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDELR2P33947 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDELR2P33947 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDELR2P33947 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDELR2P33947 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDELR2P33947 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDELR2P33947 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDELR2P33947 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KDELR2P33947 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDELR2P33947 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDELR2P33947 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDELR2P33947 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDELR2P33947 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDELR2P33947 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KDELR2P33947 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDELR2P33947 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDELR2P33947 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDELR2P33947 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDELR2P33947 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDELR2P33947 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDELR2P33947 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDELR2P33947 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDELR2P33947 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDELR2P33947 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDELR2P33947 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDELR2P33947 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDELR2P33947 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDELR2P33947 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDELR2P33947 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDELR2P33947 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDELR2P33947 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDELR2P33947 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDELR2P33947 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDELR2P33947 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDELR2P33947 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDELR2P33947 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDELR2P33947 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDELR2P33947 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KDELR2P33947 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDELR2P33947 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDELR2P33947 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDELR2P33947 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDELR2P33947 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDELR2P33947 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDELR2P33947 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDELR2P33947 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms